机动新撰组之萌动之剑第1集剧情介绍：

京都开始实施西化政策以来，不仅市容大幅改观，最大的改变就是妖怪人名册的建立使得妖怪可以合法的与人类和平共存，协助新组织维护人妖和平的就是机动新撰组，而从中捣乱企图利用妖怪力量统治世界的是飞燕组.而突然出现在大家眼前的男孩龙之介…

机动新撰组之萌动之剑第2集剧情介绍：

为了阻止龙之介回上海，包括阿凉在内竟想用美人计留住龙之介，于是跟源内商借恋爱药，想不到近藤误拿公妖怪用的药，而且还喷到章鱼道僧身上引发混乱，春意盎然的章鱼妖怪到处抓美女，新撰组当然得出面阻止，虽然表现差强人意，但小夜子似乎是对龙之介产生了一些情愫

机动新撰组之萌动之剑第3集剧情介绍：

在龙之介的建议下机动新撰组加上小夜子一行人前往有马温泉泡汤休息，除了近藤积极设计龙之介和小夜子变成一对的计画之外，源内的温泉挖掘机实验也是这趟旅行的重点，想不到在汤泉池畔出现的红蟾蜍妖怪打乱了所有计画，还把有马温泉搞的一团乱…

机动新撰组之萌动之剑第4集剧情介绍：

近藤担心龙之介对女人没兴趣会坏了她促成他和小夜子之间的好事，进而让阿凉伤心，因此硬带著龙之介到祇园去玩女人，也因此龙之介认识了小雪，小雪因为一直不得客人欢心而被老闆威胁要开除她，龙之介不忍心她那么担忧因而拍胸脯表示一定会帮她，想不到…

机动新撰组之萌动之剑第5集剧情介绍：

为了撮合龙之介和小夜子，近藤这次接受源内的建议，採用心跳加速坠入爱河的策略，然而阴错阳差，龙之介和小夜子居然被美姬派出来的妖怪追杀，近藤带著冲田和土方一起去拯救他们，想不到土方竟然在解决了牛妖之后大闹京都，原来那是源内为土方特制的机器人…

机动新撰组之萌动之剑第6集剧情介绍：

歌舞伎演员雪之丞让小夜子著迷不已，于是近藤想利用他来刺激龙之介，想不到雪之丞竟然是九尾狐狸妖怪，巧合的是冲田的白狐母亲也在此时出现，原来他们都是为了冲田口中母亲遗物的那支笛子而来，冲田这次与母亲的重逢也釐清了她的身世之谜…

机动新撰组之萌动之剑第7集剧情介绍：

近藤屡次用计想让龙之介和小夜子变成一对，可是每次总是失败，于是她决心向神明求助，她请出了六条御息所，却踫上六条御息所开出替她寻找光源氏才帮忙撮合龙之介与小夜子的条件，近藤和美姬为了实现愿望使出各种方法讨六条御息所欢心，然而却因此引发了混乱

机动新撰组之萌动之剑第8集剧情介绍：

不小心在澡堂枉死的龙之介，又再次借助猫丸的力量起死回生，然而当他醒过来时却惊觉自己居然成了女儿身，原来是猫丸错置了女人灵魂到他体内，龙之介一心想再死一次以便换回男人的灵魂，然而这时近藤却又对他展开逼婚行动，偏偏又遇上飞燕组火上加油…

机动新撰组之萌动之剑第9集剧情介绍：

京都街上出现一个卖糖人专卖妖怪糖，非常受小朋友的喜爱，就在同时也出现许多小孩失神的事件，原来这卖糖人身旁的老婆婆是专吃小孩灵魂以维持美貌的鬼子母神，近藤看见妖怪糖想起来自己的身世，把改变她人生的阿凉视为母亲，而这样的心情，也让她捲进这次的事件…

机动新撰组之萌动之剑第10集剧情介绍：

冲田自从被假龙之介告白之后一直牵挂著这件事，对于龙之介始终没有后续动作她也感到迷惑，近藤不顾自己也对龙之介开始心动的感觉鼓励她向龙之介告白，然而就在此时飞燕组卖妖计画打乱了一切，冲田在美姬的煽动下对自己是半妖人身份感到自卑，决定离开新撰组…

机动新撰组之萌动之剑第11集剧情介绍：

天上突然出现一个饺子飞行船，从里头跳出来了一个可爱的女孩，原来这女孩名叫兰兰是龙之介在上海认识的未婚妻，就在不知该如何处理这个问题时，又出现一个烧卖飞行船，原来它的主人邪骂也和兰兰一样来自中国，龙之介，新撰组，兰兰和邪骂之间的纠葛引发京都大乱…

机动新撰组之萌动之剑第12集剧情介绍：

总是与新撰组作对的飞燕组一行人突然前来示好，表示希望未来能够合作共同维护京都的安全，想不到这竟是吸血鬼蒙太酋伯爵在幕后操控的计画，虽然龙之介被兰兰逼的晕头转向，近藤等人也因为兰兰搞的一团乱，但当他们发现兰兰被蒙太酋伯爵抓走时都非常著急

机动新撰组之萌动之剑第13集剧情介绍：

吸血鬼蒙太酋伯爵利用飞燕组占领了新撰组，然而他真正的目的原来是文福藏在龙之介体内的皇帝之器，为了保护龙之介，近藤，土方，还有冲田都葬送了性命，所幸有猫丸帮助她们死而復生，然而龙之介却还是无法保住皇帝之器命丧蒙太酋之手，最后兰兰为了保护大家决心…

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