代号蓝色行动第1集剧情介绍：
中国公安边防水洲支队指挥部内，参谋长邓锋站在屏幕前解说案情，据可靠消息，近期珍珍国际偷渡集团蛇头“珍珍”将会乘坐“建荣号”到公海与国际偷渡集团的运输船“阿芙罗号”会合，这次的任务就是抓住他们，任务代号“蓝色行动”。
翌日晚，建荣号靠岸，偷渡集团大蛇头洪雷正等待开船通知，卧底警员肖克凡(化名为阿勇)故意剪断线路，拖延开船时间，不久发现几个保镖簇拥着一个包着头巾的神秘女人上了船，阿勇直觉大蛇头珍珍终于出现了。此时静静停在海港里的几艘巡逻艇像离弦之箭一般朝建荣号驶来，实施抓捕计划，蛇头洪雷命人将偷渡客全部推入海中，他则拉着那名神秘女子准备逃跑，慌乱中，神秘女子被阿勇打中，洪雷趁机跳海逃生。
神秘女子虽然被警方抢救过来，但面对肖克凡的审问却不愿作答，最终调查获知神秘女子名叫伊梅，并非珍珍。行动失败的肖克凡疲惫的打电话给远在美国的妻子卓雅。
洪雷对肖克凡怀恨在心，设计了一场枪杀，对肖克凡连开数枪…毫无防备的肖克凡中枪后倒地，险些丢掉性命。对于这次枪击事件，大蛇头韩丹红气愤地指责了洪雷，伤好后的肖克凡被派往珍珍的老巢富安，任命为富安边防大队的副大队长，誓要破获“珍珍”偷渡集团。在洪雷的一次交易中，肖克凡抓获了中间人，打算放长线钓大鱼……
代号蓝色行动第2集剧情介绍：
目标车辆最终停在一个小旅馆外，肖克凡紧密布置抓捕现场，顺利抓捕一批偷渡者，却还是没有抓到狡猾的洪雷。
在路上，韩丹红飞速驾驶的红色跑车不幸与卡车相撞，受伤的韩丹红被恰在现场的肖克凡送去了医院，还好韩丹红的伤势不重，韩丹红对肖克凡产生了微妙的情愫。
卓雅接受上级命令回国，秘密以国际刑警的身份调查粱凯莉这个国际偷渡集团的首要头目及她的弟弟梁冠成和她的干女儿韩丹红，协助侦破偷渡集团。找到粱凯莉的犯罪证据，进而摸清粱凯莉在中国的帮凶“珍珍”，无巧不成书，韩丹红曾是卓雅在美国一起上大学的室友，在这期间她按组织要求对任何人都隐瞒自己的真实身份。卓雅和肖克凡这对夫妻终于久别重逢，两人分外高兴。
化学鬼才顾可民教授和学生吴晓研究出了一种新型毒品，用廉价的化学原料就能人工合成与毒同样功效的毒品，这个配方是众多毒枭都梦寐以求想要得到的。顾教授将最新型的毒品制作配方纹在了吴晓的身上，不知道此秘密的人看图案只是一条蝎子。这个配方只有顾教授和吴晓知道。为了将新型人工合成毒品配方据为己有，吴晓杀死了自己的老师。
毒贩把吴晓绑架了，逼他交出配方，最终却一无所获。曾是肖克凡同学的李超是缉毒大队的侦察员，为了抓获贩毒团伙，来到肖克凡所在的边防支队配合办案。而此时，韩丹红也接到珍珍命令指挥洪雷活捉吴晓。
代号蓝色行动第3集剧情介绍：
李超在抓捕吴晓的过程中，与洪雷枪战，在吴晓的干扰下，李超中枪牺牲，肖克凡陷入深深的自责。
刚回国不久的卓雅打算先找份工作安顿下来，好好跟肖克凡在一起生活。韩丹红告诉卓雅金石湾度假村有她姑姑的股份，她现在是这个度假村的经理，房子和车子不用自己花钱，并且提供了海景公寓让卓雅住。卓雅去一家公司面试，老板对卓雅的资历十分满意，本来想录用卓雅，但一听说她的丈夫是警察，就委婉拒绝了。一心创业的卓雅盘了一间时装店，订金是是向韩丹红借的。开业初韩丹红开心的准备了两瓶红酒前去祝贺，却在店外看到卓雅和肖克凡幸福地庆祝开业，转身黯然离开。
肖克凡接到电话归队开会，警队要求所有人关闭手机。内容是珍珍国际偷渡集团已经收了重金要把吴晓从中国偷渡到国外，这是国际人贩组织与国际贩毒组织连手策划的，支队目标是不惜一切代价抓到吴晓。
卓雅的时装店被人砸了，因拨打肖克凡的电话关机，她只好打电话向韩丹红求助。韩丹红去时装店的路上拨通了肖克凡的电话，更巧的是两人同时到达时装店门口，这让卓雅有些失落。通过反复思索，肖克凡认为砸店的人有可能是冲自己来的。
代号蓝色行动第4集剧情介绍：
卓雅一直与身在美国的搭档罗杰（化名为迈克尔）通过网络进行着秘密来往。
经过这次风波，肖克凡唯恐再发生意外，劝说卓雅关掉了时装店，卓雅待业在家。韩丹红早在卓雅住的公寓里装了监听器，时刻监听肖克凡和卓雅在屋内的谈话。
肖克凡的两个助手徐涛和于青蓝是一对甜蜜的活宝恋人，于青蓝带徐涛面见父母，徐涛猛拍两老马屁，最终获得两老认可确定关系，两人打算结婚。
肖克凡和徐涛来到白浪村村长林香农的家里了解村里近期失踪的“淦阳号”的情况。另一边，劫船的洪雷把手机交给淦阳号的船长阿海，要他向家里打电话。被逼破之下，船长阿海接过手机向村长林香农报了平安，称船出了故障正在就地抛锚维修。船员阿禾趁人蛇不注意，从船上跳入海中，欲逃回白浪村报信。
肖克凡经过找洪雷的老婆和村长林香农调查证实，“建荣号”上中枪的神秘女子伊梅，是洪雷的情人，洪雷为了伊梅已抛妻弃子，好几年没回过家了。而伊梅的家境也很窘迫，她的父亲已失踪多年，只有老母亲艰难的维持家计。
警官江凯告诉肖克凡，据目击者提供线索，卓雅的服装店被砸当天，一辆黑色的比亚迪一直停在服装店的对面，她当时记下了车号，根据车号调查到，车主是青山度假村的老板郑月茹，还告诉肖克凡这家度假村的背景很深。
代号蓝色行动第5集剧情介绍：
时装店被砸的事情已水落石出，原来是卓雅被那个转让店铺的老板给骗了，店铺老板因欠债所以把店铺低价转让给她，债主以为卓雅和店铺老板是一伙的，所以把卓雅的时装店砸了。
从“淦阳号”跳船的阿禾逃回了白浪村，带来船被洪雷劫持的消息，据说洪雷还命人在船上改造了一个密封舱。白浪村村长林香农马上到局里反应“淦阳号”的情况，海警部队查遍所有宾馆，都没有找到洪雷的下落，只有金石湾度假村这个著名的风景区没有查，因为此度假村代表着市里的旅游形象，不能随便查。
阿禾向林香农透露“淦阳号”底舱里有五百吨柴油。是洪雷在公海向外国游船购买的，肖克凡始终认为洪雷走私柴油并不是目的，目的还是在于偷渡。他和徐涛分析洪雷有可能会让人蛇冒充海员的方式偷渡出境。通过排查，警方在一个打印店老板——马平身上发现疑点。肖克凡申请了电脑特别介入权，从马平的邮件中查到一些偷渡分子的照片，证实他的任务是帮偷渡分子伪造假证件。肖克凡和徐涛二人跟踪了找马平来办证的花衬衫男子，又观察到花衬衫开的黑色比亚迪和服装店被砸当天门口停的一样。边防大队队长郭万全马上和市局联系，请求配合调查金石湾度假村。
马平和人蛇成功交易后，不久得知自己的签证顺利办下来了，异常兴奋，万万没料到这是一个请君入瓮的局……
代号蓝色行动第6集剧情介绍：
韩丹红在金石湾度假村举办了派对，派对上鹏程公司的董事长梁冠成不禁对卓雅起了色心，韩丹红强求卓雅在度假村留宿一晚并替自己接待一下客人。
海警巡逻部队发现了“淦阳号”的位置，边防部队为了不打草惊蛇，一直按兵不动。不久该船在公海上消失了。肖克凡判断洪雷即将准备“出货”。
为挑拨肖克凡和卓雅的关系，韩丹红怂恿肖克凡带市局同志来金石湾度假村例行检查。搜查其中一个套房时，肖克凡看到的不是别的，而是卓雅正在和别人打牌。这次行动显然失败了，肖克凡气愤的转身离开。
肖克凡觉得归国后的卓雅变的陌生了，于青蓝劝肖克凡要对卓雅多关心，并帮肖克凡为卓雅选了一双新鞋，次日早，卓雅回到家中，看到家里被收拾的十分整洁，肖克凡不仅为自己买了新鞋还准备好了饭菜。等了一夜的肖克凡见到夜不归宿的卓雅后，独自喝起闷酒来，卓雅又感动又自责。
马平人不见了，前去拿签证时被守候的蛇头林高义扣留，他私下给老婆阿媛发信息，让她千万别给自己打电话，以防被警方监听。以至于肖克凡和徐涛二十四小时轮流蹲守在马平家附近，却没有新发现。
代号蓝色行动第7集剧情介绍：
肖克凡推断，那辆黑色比亚迪应该会去白浪村，并意外从林香农家的花匠黄显之那了解到这辆车好像在村内出现过。肖克凡找到林香农配合调查比亚迪的行踪事宜，谁料林香农大张旗鼓地用广播告诉了各位村民，计划被打乱，肖克凡只好收队。
卓雅向韩丹红提出想到度假村和她一起工作，韩丹红只好答应了。卓雅告诉肖克凡她要到度假村做经理助理，自食其力。肖克凡对卓雅去这种场合工作坚决反对，但卓雅执意不听，两人不欢而散。
吴晓被关在一间密室内，如同犯人一样。他告诉关押他的人，如果见不到“珍珍”他就拒绝吃饭。不久一个女人带来一本护照和光碟来到关押吴晓的密室，让吴晓熟悉模仿马平的语气及姿态，扮演马平从机场出镜。吴晓看着光碟里的马平，感觉自己的外貌确实有点像他。不久，吴晓被花衬衫接出了密室，送往机场，韩丹红坐在车后。
伊梅趁夜里偷偷回到家，被蹲守的肖克凡发现了。肖克凡揭露了洪雷所说的伊梅父亲在日本发财的谎言，实际伊梅父亲已经去世了。做通了伊梅的思想工作后，肖克凡从伊梅口中得知人蛇都分散住在附近村子里，晚上在黑礁湾碰头，出海后在公海换乘淦阳号。待出发的珍珍集团察觉到了警方就在附近。马上通知洪雷改变偷渡地点从白浪村出发，伊梅偷偷向肖克凡报告洪雷计划有变的消息。暴躁的洪雷用枪逼着林香农借船给他，林香农被洪雷绑架的消息传开了……
代号蓝色行动第8集剧情介绍：
公安局接到林香农被洪雷绑架的消息立即采取行动，肖克凡带人及时赶到码头实施抓捕，蛇头洪雷在与肖克凡的搏斗中被正法，警队顺利抓捕了一批人蛇。肖克凡、徐涛、于青蓝等人核实了所有人蛇的真实姓名和籍贯，只发现一名叫林高义的人蛇是村长林香农的亲戚，并没有发现吴晓。这时，肖克凡意识到这或许是珍珍使的调虎离山计。
肖克凡急忙来到机场出发大厅，命令机场人员对出境旅客的身份进行排查。这时，守在机场大厅门口的韩丹红一看到带队赶来的肖克凡，立刻通知吴晓取消原计划。肖克凡抓捕吴晓的行动再次失败。机场保安员在出境旅客的资料里查到了马平的信息。肖克凡意识到对方用的是声东击西，先把洪雷抛给警方吸引警方的视线，然后利用马平的合法证件把吴晓偷送出境。
急躁的吴晓又被韩丹红带回了密室，他强烈要求和他的老板通话，韩丹红经过申请后，满足了吴晓的要求。
韩丹红委婉解聘了卓雅，告知粱冠成此时是安慰卓雅的好时机。梁冠成约卓雅吃饭，卓雅对粱冠成盛情难却，只好答应了饭局。
肖克凡提审人蛇林高义，但是没有得到任何有价值的信息。此时警队发现了一具伪装成马平样子的尸体。但在肖克凡看来死者并不是马平。于是，警队派人二十四小时监视马平的妻子阿媛。
代号蓝色行动第9集剧情介绍：
肖克凡回到家中，看着躺在沙发上喝醉睡着的妻子卓雅，觉得他们越来越陌生了，他希望卓雅和韩丹红、梁冠成等人保持距离，卓雅满腹委屈，但是碍于组织纪律，自己的秘密身份不能对丈夫道明。肖克凡通过卓雅的聊天记录，了解到妻子的外遇叫迈克尔，是卓雅的美国同学。面对妻子的默认，肖克凡感到被自己的妻子被背叛了，随后气愤的搬去边防大队去住，两人的误会越来越深。
吴晓的大老板亨特对珍珍这次失手很气愤，梁凯莉向亨特承诺珍珍是最优秀的行家，吴晓肯定会在十天内被送出国。
别有用心的梁冠成让卓雅到他的生豪集团海产品进出口经营部当第一任部长。韩丹红警告梁冠成不要打卓雅的主意，梁冠成称这正是老板的指示，她搞不定的事情只好由自己来办。韩丹红不忍心卓雅被卷到这个事件中来，告诉卓雅，梁冠成的生活极不检点，劝她尽快辞职。
肖克凡在打印店对面的公寓里租了一间房，时刻监视打印店内的活动。犯罪分子用一起交通事故引起警察的注意，又声东击西，最后从后门破墙而出，待到马平家里查看，已经空无一人，阿媛也失踪了。通过查询事故车的车牌号，了解到事故车辆属于清水建筑公司。此时尸体检验报告出来了，可以断定尸体应该是个渔民，并非马平。
代号蓝色行动第10集剧情介绍：
卓雅调查生豪集团的来往客户资料，但是据部门人员透露，最早期的客户资料已经不存在了，调查陷入困境。
肖克凡再次去白浪村调查案情，看到林香农的脸上有伤，得知因为林高义被抓，村里的人对林香农大义灭亲的做法很不理解，是被村里人打成这样的，村民还威胁林香农要开除他的族籍。林香农带肖克凡参观了村里的祠堂，在林香农心里这个历经风雨的祠堂是个神圣的地方，他一直努力做好村长改善村民的生活条件，就是害怕自己死后排位不被放进去。伊梅找到肖克凡，告诉了肖克凡通知洪雷改变偷渡地点的号码，号码经过调查竟是白浪村村委会。肖克凡对村长林香农产生了很大的猜疑。
肖克凡在白浪村遇到卓雅和梁冠成，他们此次前来考察海产品养殖场的事。在一起参观海产品加工厂院子时，肖克凡发现冷库边上有个广东话口音的男人很可疑。于是找到当地民警何雷了解情况，从何雷口中得知林香农为村民解决就业问题，不会用外地人。并且得知最近有个开红色跑车的女人经常来找林村长。肖克凡联想到了韩丹红的红色跑车，对韩丹红产生了怀疑。
肖克凡在白浪村假装喝醉，向搀扶自己的花匠黄显之询问最近村里的可疑情况，但并没有从他口中没有得到任何有价值的信息，肖克凡感觉黄显之并不像表面看起来那么简单，白浪村疑点重重。
代号蓝色行动第11集剧情介绍：
在白浪村的地下密室内，失踪已久的马平被绑在凳子上拼命挣扎，被激怒的花衬衫用木棍将他的腿打成重伤……
肖克凡对韩丹红产生怀疑，侧面打探得知韩丹红从小父母双亡，五岁时便随干妈去国外生活。
边防战士这次又抓获了一起走私中华烟的案子。抓捕行动非常成功。梁冠成约韩丹红在海边见面，向她传达珍珍集团欲第二天送吴晓从海路出发，让韩丹红务必用美人计拖住肖克凡，使得吴晓顺利逃走。边防部队得知消息后，封锁了所有的码头和港口。各队出发，肖克凡被留在总部应付突发事件。
韩丹红让肖克凡到一家酒吧找她，故意喝醉向肖克凡表白爱意，并偷偷把追踪器放入了肖克凡的口袋中，事后肖克凡将计就计，让于青蓝带着追踪器去白浪村东边码头，错误引导敌人。通过这次与韩丹红接触，肖克凡感觉她做这些事情也是逼不得已的，其实本质上并不坏。
罗杰通知卓雅盯住吴晓，防止他乘坐“巴比特”号轮船偷渡逃走。卓雅偷偷跟踪了接走吴晓的汽车，捡到从车上扔下的手机SIM卡，把卡内的信息全部转发给了邓峰，邓峰得到吴晓将会从舟山码头离开的信息，命令警队前往此地，终于顺利抓捕了吴晓。
代号蓝色行动第12集剧情介绍：
粱凯莉和韩丹红很快知道吴晓被抓的消息，准备按照老规矩，杀掉吴晓来隐藏自己。梁凯莉觉察到韩丹红的微妙变化，预感到韩丹红很快会和自己划清界限。在监狱中的吴晓对于协助警方破案毫无用处，向肖克凡提供不了有价值的信息。邓峰决定先关押吴晓，用它引出珍珍。夜晚，肖克凡在纸上写着一个个的线索，想从中找出一些头绪。
富安边防大队长郭万全到清水镇吴镇长处打听村里外来人口的信息时，对卓雅的怀疑徒然上升，他向罗树新汇报了此事，要求盯住卓雅。罗树新请示邓峰后，邓峰让他先按兵不动，等抓到珍珍一切就会真相大白。肖克凡推断韩丹红和林香农都属于珍珍集团犯罪分子，预计放长线钓大鱼用他们俩引出“珍珍”。
徐涛接受邓峰指令被调入看守所里就职，秘密监督珍珍集团对吴晓的举动，争取打入偷渡集团内部。因任务对外保密，只有依依不舍得递交专业报告，离开了战斗多年的警队和一直牵挂自己的于青蓝，前往新的岗位。
卓雅在梁冠成的办公室内安装了摄像头还查到了很多人的身份资料，其中也包括疑似韩丹红父母的身份资料，马上把资料发给了自己的搭档罗杰，罗杰认为这些资料很可能成为一个策反韩丹红的突破口…….。
代号蓝色行动第13集剧情介绍：
徐涛想多赚点钱准备和于青蓝的结婚，结果赌球反而输了两万，于青蓝知晓后十分生气。
卓雅的搭档罗杰来到中国协助卓雅办案，他此次化身为专做与中国运输生意的迈克尔，卓雅向梁冠成引荐了罗杰，梁冠成表示愿意与他的公司合作。迈克尔以运输公司代表的身份来到金石湾度假村时，梁冠成见两人十分亲近，找人故意拍摄了一些卓雅和迈克尔在一起时的亲密照片。
罗杰查出韩丹红的父母很可能是在二十多年前的偷渡事件中遇难的，韩丹红肯定对自己的身世还不了解，韩丹红是梁凯莉的养女又是偷渡集团的骨干人员，如果能够成功策反韩丹红，那么将会对破案很有帮助。
于青蓝和小董监视韩丹红时，发现林香农到过韩丹红的家里谈事情。韩丹红向林香农传达梁凯莉的命令，要求除掉监狱里的吴晓。之后林香农以林高义生日为由，委托徐涛给林高义带几本发律书，书上写有“书上有毒，木器浸毒，干掉吴晓”的暗语。不知情的徐涛把书转给了林高义，林高义接到命令后，躲避监狱看守人员在牙膏里下了毒，预谋杀掉吴晓。
代号蓝色行动第14集剧情介绍：
梁凯莉为了不节外生枝，让梁冠成拒绝与罗杰的公司合作。罗杰为了避免梁冠成怀疑，只有先回美国，卓雅送走罗杰的时候，肖克凡来到卓雅的办公室找妻子，梁冠成故意使计把卓雅和罗杰的亲密照片摆在卓雅的办公桌上，肖克凡看到后十分气愤，误会罗杰就是第三者，找到罗杰与他大打出手。
罗杰告诉卓雅，待有确凿证据证明韩丹红的父母死于偷渡时，再告诉韩丹红真相，那时策反韩丹红会更加容易。肖克凡认为上次在酒吧韩丹红给她的感觉是可以争取到警方这边来的，他此时也向邓峰申请策反韩丹红。
林高义找到看守所监房的监狱老大，怂恿监狱老大想办法把吴晓弄到自己的牢房里。老大找到吴晓牢房的号友揍了吴晓一顿，受伤的吴晓向警方申请换监狱室，于是吴晓被带到了林高义的监狱房，待看到一个监狱室的林高义后，吴晓预感到珍珍将有行动，每天惶惶不安。
国外的毒枭亨特出大价钱让国际偷渡组织在国外的首领梁凯莉停止杀害吴晓的计划，时间紧迫，韩丹红命令林香农一定照办。林香农只好以徐涛转交的凶器即是毒书籍为由，威胁徐涛马上制止林高义杀害吴晓。还好徐涛及时赶到，吴晓险些丧命。
韩丹红无意中向林香农表示她并不是珍珍，二人对究竟谁是“珍珍”感到迷惑。
代号蓝色行动第15集剧情介绍：
肖克凡和于青蓝去白浪村村长林香农家里调查，林香农抱怨，由于边防警察的频繁调查，银行已经拒绝了他的贷款请求还同时失去了好几单合同。
在海景公寓房内，卓雅红肿着眼睛，凝视着她与肖克凡的合照。对于肖克凡的误解，卓雅有口难辩，此时肖克凡也在办公室内望着桌上卓雅的照片，回忆起两人以前的甜蜜，陷入深深地思念。
梁凯莉认为把监狱中的吴晓偷渡到国外是相当困难的，向亨特提议找人把吴晓身上的配方弄到手比较容易操作。韩丹红接受命令前去通知林香农时，被于青蓝跟踪，卓雅为了不打草惊蛇中途扰乱了于青蓝的跟踪计划。
接到命令的林香农找到徐涛，向徐涛表示吴晓身上有个祖传秘方，有人愿意出高价买这个秘方，如果可以把秘方弄出监狱，二人都会发财的。之后徐涛在不知情的情况下，银行卡上多了2万，于青蓝误以为是赌资，觉得徐涛赌瘾极大已无药可救了，徐涛有口难辨。伤心地向于青蓝提出分手。
罗杰通过移民局查到卓雅提供的身份证复印件上面的人基本都在偷渡过程中遇难了。卓雅觉得已经到了策反韩丹红的时机。肖克凡偶然从伊梅处得知，最近一两天总有一辆卡车在三更半夜时开到村里的冰库，肖克凡很疑惑，找伊梅帮忙，夜晚偷偷潜到冰库调查。
代号蓝色行动第16集剧情介绍：
肖克凡在冷库里查出了走私烟，却被神秘人困在了冰库里面，还好伊梅马上找人求救，肖克凡才捡回了一命，韩丹红在医院一直照顾肖克凡。
徐涛找吴晓证实了秘方确有此事，但吴晓表示他把秘方存在了国外银行的保险柜里，不把他从监狱弄出去是不会说的。亨特得知吴晓给自己留一手的消息后，希望梁凯莉尽快将吴晓十天内送出监狱。凯莉只好让珍珍亲自出马来办此事。
郭万权和肖克凡带着搜查令来到林香农家里，林香农畏罪潜逃了，花匠黄显之称自己今后打算回贵兴老家。经过搜查，在一间地下密室内里发现了被绑架的马平和阿媛。肖克凡发现有人刻意割断了埋在密室地下的网线，林香农不会上网，马平被他关在小石屋内更不允许上网，这里只有黄显之的嫌疑最大。
韩丹红收到珍珍约她见面的消息，林香农也到了见面的地点，黄显之称自己就是珍珍。他向二人转告了梁凯莉的吩咐，一定要把吴晓从监狱里弄出来。
林香农用高价钱收买了徐涛，威胁徐涛如果不帮忙就说出上次林高义刺杀吴晓时的凶器是他传递的，说服徐涛把吴晓弄出监狱，徐涛只好答应。
肖克凡通过人脸拼图技术，查到黄显之是假名，他的真实姓名是陈德生，曾是一名蛇头，是珍珍的可能性极大。
代号蓝色行动第17集剧情介绍：
肖克凡在搜查林香农家时发现一封林香农留给自己的信，信中他自称珍珍，肖克凡经过字迹分析，认为这是真的珍珍在故布疑阵，想利用林香农脱身。
徐涛利用假提审证件把吴晓带出了监狱，林香农在外接应并成功利用掉包记躲避了追捕的警车。警察待在青山岭追到嫌疑车辆时，车内已空无一人。黄显之、粱冠成、林香农、徐涛、吴晓一起躲到了一所废弃的仓库里。粱冠成在吴晓身上还是没有找到毒品配方。疑心的梁冠成一直对徐涛和吴晓进行秘密监听。
边防大队里，陈德生（曾用名为黄显之）、林香农、吴晓、徐涛等人统统被A级通缉了。徐涛得知自己被通缉后一脸沮丧，夜晚独自坐在床垫上看着于青蓝的照片黯然神伤。而此时，于青蓝也因一直联系不上叛变的徐涛而悄然落泪。吴晓对于被通缉一事不以为然，一直兴奋的准备领奖感言…….
梁凯莉和亨特准备实施一个“登月计划”，即偷渡计划。梁冠成企图在偷渡出境之前问出吴晓毒品配方的保存密码，但吴晓不肯交代，珍珍只好选择把吴晓偷渡出境。
通过安装在梁冠成办公室内的摄像头，卓雅发现梁冠成随身携带的的一个U盘上可能藏有重要情报。夜晚，卓雅偷偷潜入梁冠成的办公室，根据监控得到的密码，在他的邮箱里拷走了几张图纸。
代号蓝色行动第18集剧情介绍：
吴晓把徐涛当作朋友，徐涛给吴晓出主意，让他向梁冠成打探何时、如何离开。吴晓果然从粱冠成那里得知了出逃方案：几个人待在一个能通过海关的集装箱偷渡到国外。集装箱是马平设计的，梁冠成从劳务市场找到一些懂技术的民工，让他们按照图纸制作这项秘密工程。
徐涛委托花衬衫帮他还球赛赌注，交给他一张银行卡并告诉他取款密码。之后此事被一直监视他们的梁冠成知晓，徐涛险些暴露卧底身份。此时边防部队内，郭万全告诉于青蓝，徐涛是被派往打入珍珍集团的卧底，于青蓝心中五味沉杂…
邓峰向警队人员公开了徐涛的身份，他随身携带的银行卡密码可以任意输入，密码就是徐涛向警队传递的暗号。经分析，得知珍珍集团要利用特殊集装箱将吴晓送走，邓峰马上通知海关严格检验货物且对梁冠成的鹏程公司的集装箱进行重点排查。
黄显之让粱冠成把卓雅抓为人质，用来威胁肖克凡。卓雅被带到一间废弃厂房时，黄显之在她身上发现了追踪器，揭露了卓雅国际刑警的身份，韩丹红很是惊讶。卓雅告诉了韩丹红她的父母并非死于海难而是偷渡，并有照片为证，韩丹红深信不已。此时邓峰也向警队人员宣布了卓雅国际刑警的身份。
马平给集装箱设置了一个机关，需要亲自输入密码，以防珍珍集团不带他出国。穿上警服的徐涛和身穿白大褂的林香农顺利蒙蔽医院工作人员的监视，把马平从医院给带了出来。由于集装箱内只能容下六个人，黄显之把最没有用处的林香农杀掉了。
第19集剧情介绍：（大结局）
肖克凡带人监视海关码头，公安各部门紧张有序的执行各项工作，准备随时实施抓捕。
亨特怕中国警方将吴晓换作警方卧底，向梁凯莉提出要到国内当场验证是否是吴晓本人。珍珍收到计划调整的消息后，只让徐涛和马平待进了集装箱并把门锁上，二人对他来说已经丝毫没有用处了。肖克凡在海关处密切注视着一个安检信号异常集装箱,打开门后,徐涛走了出来并向肖克凡交待了珍珍的计划有变。
邓峰带来国际刑警组织的消息,亨特和梁凯莉已来到太平洋,目的很可能是接吴晓和珍珍等人。边防战士马上寻找犯罪份子的行踪。
当韩丹红从梁凯莉口中得知自己的父母确实是在偷渡中遇难时，心情难以接受。声称要和他们划清界限，黄显之把心情激动的韩丹红打晕在地。此时，边防警察已经将他们藏身的别墅严密包围，欲将珍珍集团一网打尽。
随后，梁凯莉、亨利、梁冠成等人纷纷被捕，吴晓被击毙，躲在窗外的黄显之向毫无防备的肖克凡连发数颗子弹，韩丹红替肖克凡挡抢身亡，死在了肖克凡的怀里，最终黄显之被击毙，卓雅和肖克凡两人之间的误会也终于化解，代号“蓝色行动”任务园满结束，我们的边防警察又开始了新一轮的打击犯罪任务……
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