血色星期一2第1集剧情介绍：
平安夜，在极寒之地的俄罗斯，一笔病毒交易成交了。
神秘女子玛雅从走私团伙的一男子处，得到了杀人病毒。而这病毒的用途，则是为了在日本制造一场病毒恐怖事件。该计划代号“BOOLDYMONDAY（血色星期一）”。血洗俄罗斯小镇后，玛雅回到日本，枪杀了一路追踪自己的俄罗斯谍报人员，便消失了踪迹。
高木藤丸是就读于弥代学院高中部的一名普通学生。表面上看来他与一般人无异，但其实暗地里，他却是曾经让日本警方也非常头疼的超级天才黑客，代号“猎鹰”。
日本方面负责病毒事件的警察厅秘密部队“Third-I”为了破解谍报人员所留下的暗号，无奈之下向藤丸求助。藤丸万分不情愿，但最终还是妥协答应帮忙。经过一场苦战，藤丸还是顺利地从数据库下下载到了一个文件，并顺利逃出。
而在学校里，藤丸瞒着所有人，通过高超的黑客技巧，揭露了一个男老师的恶行。这个老师因此而被解雇了。代替他的，是一位名叫折原玛雅的美丽女老师。虽然藤丸装的若无其事，但他的好友九条音弥却对此有所察觉。
血色星期一2第2集剧情介绍：
在购物广场发生的一连窜事件，结果被证实不过是恐怖分子放出的一个烟雾弹。在千钧一发之际，多亏藤丸及时告诉大家病毒是假，才阻止了一场惨剧的发生。但他们通过这一事件也清楚地认识到，这不过是恐怖分子一系列犯罪的一次预演。真正的悲剧才揭开幕布而已。
藤丸好不容易从困境中脱身，便立刻赶往医院看望妹妹遥。可他赶到医院，却发现，一直给妹妹看病的女医生京子已经被人杀害了。原本躺在她身边的遥更是不知去向。就在藤丸感到惊慌失措的时候。电话响了。是把遥绑走的男子打来的。他威胁藤丸，如果想要救自己的妹妹，就入侵THIRD-i的数据库。按照电话指示终于找到妹妹的藤丸，惊恐地发现遥的身上被人安装了遥控炸弹。别无选择的藤丸最终还是答应了恐怖分子的要求，开始了对THIRD-i数据库的黑客行为。
另一方面，恐怖分子还给THIRD-i本部发去了联络，告诉他们“已经给某位女性送去了真正的病毒”。终于，恐怖分子的的魔手伸向了普通市民。而警方和藤丸所要面对的，还有恐怖分子集团设下的重重陷阱。而藤丸就读学校的生物老师，折原玛雅也逐渐露出了本性。
血色星期一2第3集剧情介绍：
藤丸和音弥怀疑，在俄罗斯发生的病毒恐怖主义事件：“圣诞节的虐杀”的录像中所出现的神秘女子，就是他们学校新来的生物老师折原玛雅。为了确认这个推测的真伪，两人结伴潜入了玛雅老师的公寓。音弥负责把玛雅老师骗出去，而藤丸则设计再次潜入她的公寓，找到了暗房里的电脑并将数据拷贝下来。但玛雅也意识到事情有变而赶回家来。终于露出真面目的玛雅掏出手枪对准了藤丸。就在千钧一发之际，THIRD-i的狙击手射中了玛雅，救下了藤丸。
THIRD-i逮捕了玛雅，并对她实施了严苛的拷问。但玛雅却完全不屈服，完全没有招供的意思。但是她提出，如果带藤丸跟着同行，她可以带着他们去他们的老巢。
藤丸和加纳，宝生一起上了车，与玛雅前往他们的根据地。结果在路上，玛雅又说出了让大家非常惊讶的话：同车的人里有他们的同伴。究竟谁才是那个叛徒！？藤丸究竟该相信谁？车里的空气凝重而不安起来。而玛雅坚持把藤丸带去基地的目的又是什么？与此同时，一个神秘的男人正在向藤丸等人靠近。
血色星期一2第4集剧情介绍：
藤丸给大家发短信，利用藏头文告诉大家，宝生才是那个叛徒。而他们一行人，也被玛雅给带到了一个没有人烟的仓库附近。宝生做出将玛雅拷住的假象，其实并没有锁上。藤丸虽然用枪对准了宝生，但却怎么也下不了手开枪。宝生开枪射中了加纳，而另一把枪则落入了重获自由的玛雅手上。而藤丸不但手上没有了枪，反而为人所制，还被抢走了USB。并被迫向THIRD-i本部放出了“加纳是叛徒”的假消息。之后她还开枪击倒了藤丸。
THIRD-i本部接到藤丸发出的消息，立刻信以为真，放松了对宝生注意。而宝生就趁机返回本部，入侵了地下室并留下了病毒。她试图利用地下室的空调设备，将病毒通过换气传播进整个THIRD-i本部。
而THIRD-i本部的监视人员终于发现情况不对。雾岛的未婚妻沙织为了确认情况而跑去了地下室。虽然及时地阻止了病毒通过空调在本部扩散的危险，但沙织却被感染上了病毒。雾岛为此而受到了极大的冲击。
而藤丸，则在玛雅的诱导下，见到了病毒恐怖分子的主脑人物，“J”。
血色星期一2第5集剧情介绍：
为了阻止魔弹之射手制定的日本再启动计划，折原玛雅不惜牺牲了自己的生命，临死之前，玛雅说出了一个很大的秘密，她把“第三个皇帝”的真实身份告诉了藤丸和音弥，它就是破坏力最强、最恶毒的氢弹，通称“沙皇炸弹”，一旦这颗炸弹在东京引爆，那么后果实在不堪设想。藤丸和音弥很清楚，他们无论如何也要调查出结果，不仅仅为了死去的玛雅，也为了拯救很多人的生命。经过调查他们发现，一个叫做“教授”的男人掌握了“沙皇炸弹”，以及联络魔弹之射手的关键钥匙，他们按照玛雅留下的线索来到横滨一家店，向一位看起来像店主的男人请教，问他是否认识一个叫教授的人。一番调查询问之后，藤丸和音弥终于来到了教授的住处，他们利用教授家的电脑终于查出了“沙皇炸弹”的所在位置，藤丸马上联络加纳，告知他所查到的结果，于是THIRD-i的成员们火速赶往现场，确认集装箱中的东西究竟是不是“沙皇炸弹”。
血色星期一2第6集剧情介绍：
中了藤丸设置的圈套的间谍，其实就是THIRD-i的情报分析官泽北，他在被雾岛等人逮捕之后坦白说自己也是不得己，因为他的儿子陵太被魔弹之射手抓去做人质，因此他不得不帮对方做事。听了这冲击性的事实，在场的所有人都哑口无言，只有藤丸在操作电脑，他找到一个“动画网站”，这个网站播放的是陵太正在无忧无虑玩耍的录像，但是配合他的动作，一只来福枪正装置在一旁，一旦点击数量超过一定数额，这个装置就能让来福枪射击。另一方面，独自一人寻找教授的线索的音弥接到响的电话，响告诉他，教授想要见见音弥，希望他一个人去，音弥马上就下定了决心。设置来福枪瞄准陵太的那个网站，有很多感兴趣的人不断点击访问，时间一分一秒过去，越来越接近限制时间，藤丸终于无法忍受怒气爆发了，他决定要再次抓住“Hornet”。
血色星期一2第7集剧情介绍：
“魔弹之射手”竟然抓了THIRD-i情报分析官泽北的儿子陵太做人质，借此要挟泽北做内奸为他提供情报，而且他还拿陵太在网上玩“杀人游戏”，藤丸对他没人性的做法十分愤怒，经过努力搜索，他终于找到了藏人质的地点，成功地安全救出了陵太。不过和陵太被一起救出的少年却让藤丸觉得有些不对劲，藤丸和秋原决定让两位少年单独谈话，试着寻找线索，结果新的事实让藤丸大吃一惊，原来这名少年就是他费劲千辛万苦要寻找的“Hornet”。藤丸调查Hornet的笔记本电脑后掌握了一定证据，而这些事实让Hornet有些动摇。另一方面，音弥赶到教授和响等他的地方，没想到等待他们的却是“魔弹之射手”的狙击，而且他还负了伤。被音弥拼命救下来的教授在事后说出了“日本再启动计划”的全部内容，另外，突然倒下的J竟然一直没能恢复意识。
血色星期一2第8集剧情介绍：
THIRD-i终于找到Hornet，而且藤丸的一些证据让他内心动摇，最终他说出了真正的幕后黑手，操纵一切的人其实就是蜘蛛，面对这个夺走了葵的生命，不知多少次把自己逼到穷途末路的蜘蛛，藤丸难掩心中的愤恨之情。这次魔弹之射手又从电视台的播出系统上下手，促使年轻人联合起来对九条总理进行体制批判，这样他也终于启动了“日本再启动计划”，让日本为恐怖核弹头疼，而且蜘蛛还侵入了THIRD-i的主系统，直接攻击THIRD-i本部。就在此时，和响一起离开THIRD-i的藤丸竟然接到了蜘蛛的来电，对方充满挑衅意味地告诉藤丸和他一起玩，藤丸怎么可能接受这样的对待，他立刻开始侦查蜘蛛的所在地，最终锁定了敌人蜘蛛电脑终端的所在位置，但是此时对方早已打开了荣誉之门。藤丸从监控录像上看到了南海，南海也打算潜入调查，没想到差点被仓野医生杀死，原来她就是蜘蛛，可是当藤丸赶到时，仓野却指证南海才是蜘蛛，还请求藤丸救自己。
血色星期一2第9集剧情介绍：
蜘蛛的身份终于得到证实，仓野医生才是蜘蛛，当她拿着手枪指向藤丸，再一次说出“我们一起玩”这句话时，藤丸不禁愕然，而且对方还说一直都在看着他，让藤丸觉得很不舒服，当蜘蛛离开现场之后，南海为了让藤丸不要管自己，抓紧时间去阻止核弹爆炸，抓住蜘蛛，不惜拿枪指着自己的脑袋。对于自己和蜘蛛到底是什么关系，藤丸怎么也回想不起来，只觉得特别苦恼，但是他知道了蜘蛛的真正目的是使用设备的告诉增殖炉让核弹爆炸，藤丸想解开密码阻止程序，但是他做不到，所以他准备直接去追蜘蛛，加纳、雾岛等THIRD-i的成员随后也陆续赶去了。就在此时，秋原终于查到了蜘蛛的过去，并且把这个事实通知给藤丸，得知自己和蜘蛛的关系之后，藤丸简直无法相信这是事实，不过他最终还是下定决心来到蜘蛛等他的房间里。关系到日本命运的一战终于来了，藤丸要去改变自己和国家的命运。
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