第1集剧情介绍：性爱视频背后的秘密
乔恩应邀来到警局，只因一对夫妻想请她帮忙找个人。这对夫妻，妻子叫索菲，几年前是个放荡的富二代，生活奢侈淫乱。之后她革面自新，与现任丈夫瑞恩相识并结婚。最近网上传出一段视频，是索菲与前男友塞米的性爱录像。这件事对索菲产生了很大的影响，因为索菲祖父去世前立下的遗嘱中明确注明，如果索菲再发生有辱门风的事，就无权再从遗产信托基金中拿到每年三百万的钱款。索菲与塞米联系后才知道，视频并不是塞米上传，而是几天前有人闯入家中，从电脑里偷走了视频。两人相约见面，不想塞米迟迟未到。索菲很担心，向警方报案又因为未超过24小时不予受理，这才找到了乔恩。
索菲刚说到一半，夏洛克才姗姗来迟，眼神迷离。相对于塞米，乔恩更担心夏洛克的情况。从警局回到褐石屋，夏洛克说出了实情。最近他总觉得头疼、失忆、嗜睡，还出现了幻觉。客房正是在幻觉中，被他砸得一塌糊涂。起初他认为自己得了脑瘤，可核磁共振结果却显示阴性。做了所有的检查，都没有查出病因。医生最后推断是得了脑震荡后遗症，原因可能就是辛维尔对他后脑的那一酒瓶。听了解释之后，乔恩理解了夏洛克最近的苦恼，在今后的生活和工作上她将更多的照顾夏洛克。她还打算在工作之余找人修葺凌乱的客房，改成有氧训练房，帮助夏洛克恢复大脑功能。
当然，索菲的委托也不能放松。夏洛克和乔恩来到塞米的住处，一进门就闻到空气中弥漫着塑料布的气味。仔细查看后，还在角落发现了不明显的胶带痕迹。可以推测，有人在屋里铺满了塑料布并对塞米痛下杀手，因此现场没有留下任何可供调查的线索。
在塞米的家里没有发现，可刚出门夏洛克就接到一通神秘电话，对方愿出一百万让夏洛克停止对此事的调查。号码是来自一次性手机，夏洛克便将自己的账号发送了过去，开口要价五百万，没想到不到一分钟钱就到账。这是夏洛克的计谋，手机查不到人，就通过汇款找人。但对方很精明，警方只能追查到一个离岸账户，由此线索中断。
次日，夏洛克和乔恩分头找到索菲的哥哥德鲁以及索菲本人交谈。索菲出丑，受益最大的就是德鲁。可德鲁并不承认上传视频，还提供了另一个情况，索菲的祖父生前对索菲的生活方式很恼怒却也不希望索菲受苦。遗嘱里还有一条，索菲被踢出信托基金时，信托基金应当出资六千万购买索菲名下的家族股份。因此即使是德鲁拿到了视频，他也不可能上传，否则损失更大。
乔恩在与索菲的交谈中，索菲同样不认为德鲁会做出这种事。当乔恩说到视频上传地点是在新布伦瑞克省的一家咖啡馆时，很显然能看出索菲的表情发生了变化。但索菲支支吾吾的否认知道那个地方，更让乔恩产生了怀疑。深入调查后才知道，原来瑞恩近期就在那里寻找可投资的房产。
当晚，警方在郊外路边发现了索菲的尸体，她的丈夫瑞恩声称妻子下午接到一个电话就匆匆出了门。乔恩查看索菲手机上的通话记录，最后一个号码正是行贿夏洛克的那个一次性手机。
夏洛克把怀疑的目光投向了瑞恩，先是上传视频让索菲出丑拿到六千万美元，然后杀死索菲尽得所有钱款。也只有他知道夏洛克受理了塞米失踪一事，才能打电话进行贿赂。很可能索菲在得知视频上传地点是新布伦瑞克省后，就猜到丈夫的目的，之后威胁要去报警，被瑞恩掐死并抛尸郊外。
然而这些都只是猜测而已，并没有直接证据证明瑞恩杀害了塞米和索菲。在警局的审讯室里，狡猾的瑞恩只承认上传视频，否认行凶。他的理由很简单，索菲也参与到此事，目的就是为了一次性拿到六千万美元，而不是每年只拿三百万度日。瑞恩所说的话已是死无对证，夏洛克还要寻找更多的证据。
当乔恩调查完瑞恩的背景，深夜回到褐石屋时，看到夏洛克傻傻的站在客厅中间。夏洛克只记得刚才自己还在地下室的工作间里整理资料，然后想到什么事才回到客厅。可进了客厅他就想不起自己为何要来，这是典型的脑震荡后遗症症状，这让他很沮丧。也许刚才就想到了破案线索，如今却什么都记不起来了。
天亮后，夏洛克打起精神，在警局查阅索菲尸体现场的调查报告。这时前台来了一个叫贝瑟妮的女人，自称知道杀害索菲和塞米的凶手。贝瑟妮是索菲之后，塞米的另一个女友，但恋情没有维持多久。此后塞米又跟一个叫露娜的女人鬼混，露娜是嫉妒心极强的人，网上传出索菲与塞米的性爱视频后，她就多次发短信威胁杀死索菲和塞米。现在索菲死于非命，塞米也凶多吉少。贝瑟妮也跟塞米拍摄过性爱录像，生怕被露娜知道后，自己会成为下一个受害者，所以来警局寻求保护。
为了证明自己所言不虚，贝瑟妮取出手机，里面有她与塞米的视频。一看到视频，夏洛克就发现与索菲的视频不同。贝瑟妮视频的拍摄角度更像是天花板的监控摄像头，赶到塞米家，果然从天花板里找到了隐藏极深的摄像头。
塞米有着变态的癖好，喜欢拍下自己与女友的激情视频。如果女方不愿意，他就会使用这种隐蔽的方法拍摄。而这也为破获塞米一案提供了证据，摄像头拍摄到瑞恩深夜潜入塞米家，在客厅四周捕好塑料布并从背后袭击听到动静下楼察看情况的塞米。看到警方提供的行凶视频，瑞恩哑口无言，只能认罪伏法。
第2集剧情介绍：丢失的钚
曼哈顿发生一起离奇命案，竟然有人在摩天大楼林立的街道上被闪电击中毙命。夏洛克从一开始就怀疑事有蹊跷，尸检也证实了他的想法。闪电击中死者的臀部，这在自然界几乎不可能，唯一的解释就是这是起谋杀案。
死者叫吉里，是能源部的检查员。最近几个月，他和妻子相互指责对方出轨。而他的妻子希瑟是名物理学家，具备制作人造闪电的知识，有重大作案嫌疑。当希瑟面对谋杀指控时，她向警方承认自己才是出轨的一方。在案发当晚，她正和情人在酒店用餐，有侍者可以作证。不过在平时的工作中，希瑟也阅读过一些有关电子激光的论文，知道有家企业正在研发相关武器。
根据希瑟提供的线索，夏洛克、乔恩、马库斯来到一家科技公司。项目负责人承认正在研制小型核反应堆驱动的电子激光武器，而且该项目需要吉里对核安全进行审核，所以没有动机杀死吉里。研制的电子激光武器已小型化，可放置在厢式货车内。根据记录，三天前被运往空军实验室进行测试，之后一直保管在公司的车库内。但夏洛克发现车厢上有水渍，而昨晚曼哈顿地区有零星小雨，说明这辆车昨晚曾出过车库。项目负责人马上查看了日志，发现已被人清空，更让人怀疑。
从路面监控发现当晚是项目资助人安柏林将载有电子激光武器的货车开出了车库。安柏林归案后交代了从日本福岛购入放射性钚，用于完善电子激光项目。因违反国内相关法规，不得不走私入境。可钚意外被盗，他才想到用电子激光武器电击吉里。本想让吉里入院一段时间，让他有更多时间找回钚，却不幸造成悲剧。
案子虽然破了，可纽约警方面临更大的问题，如果丢失的钚被恐怖份子掌握，就会危及数百万人的生命。核安全局的科勒被派来配合警方行动，调取钚被偷时间周边地点路面监控，乔恩发现有辆快递车形迹可疑。一般快递公司都会利用软件优化路线，避免左转浪费油耗。可这辆快递车却在凌晨时分等待红灯左转，不符合优化路线的原则。从车身上的标号，警方查到该车于几天前被盗，之后被丢弃在另一个州的公路边。
科勒对该辆快递车检测后，车身果然发现辐射残留。夏洛克查看了里程数和车轮，认定该车曾到过二十公里范围内的碎石路面。以此范围进行调查，因制作爆炸物入狱，现在处于保释期的维舍进入了警方的视线。对维舍的住所进行搜查，在地下室找到了维舍的尸体，周边有高浓度辐射残留。这让夏洛克和乔恩更加担心，有恐怖份子制作了脏弹，欲图对纽约市进行袭击。
根据维舍手臂上的纹身，警方确定他在服刑期间加入了一个白人至上的种族主义团体。或许是该团体让他制作了脏弹，并试图在其他肤色人种聚集区引爆。可对该团体核心领导人问讯后，发现所谓白人至上只是用来招募的噱头而已，他们更注重金钱。维舍是个很聪明的人，动手能力极强。在监狱时把拆散的手机拼装起来出售，能给团体带来不少收入。在维舍出狱后，团体领导人并没有过多联系维舍，只听说有几个欧洲人找过他，想制造炸弹。
在美国境内寻找几个欧洲人，简直如大海捞针。这时911传来消息，有名女性报警称有人把炸弹藏在出租车里，想袭击清真寺。从她的描述来看，很可能就是一枚脏弹。让科勒派人检查所有一万多辆出租车和三百多所清真寺，并不现实。马库斯在实时路面监控里发现一辆出租车亮着空车灯，却不上下客。该车之后停在清真寺门前，司机随即下车离去。
就在葛雷森警监安排人手前往拆弹时，夏洛克却发现了疑点。现在是星期三的下午，怎么可能选在清真寺没人的时候发动恐怖袭击。而这个清真寺附近有家国际知名钻石品牌总部，其拥有价值上千万的钻石库存。夏洛克大胆推测，这些都是幌子，他们真正的目的是为了引开警方注意，以便行抢劫之实。
在夏洛克的建议下，纽约警方调整行动重心，将正在打劫的四名荷兰人抓个正着。车上的炸弹，经鉴定只是威力不大的普通炸弹。失窃的钚也在四人租用的仓库内找到，及时作了处理。
从整个事件来看，偷窃钚并给警方留下制作脏弹的假象，都是为了打劫钻石。可这四名荷兰人又是如何得知安柏林手中有非法入境的钚？夏洛克想到了一个人，一直配合寻找脏弹，实际处处误导警方的科勒。经查，科勒在荷兰结识了新女友娜塔莉，而娜塔莉的表兄正是四名劫匪之一，那个报警电话也是娜塔莉拨打。娜塔莉已经交待，科勒收受安柏林贿赂放非法钚入境，并将此事告诉了她。至于科勒是中了美人计，还是由他本人策划了整个行动，这都已经不重要，科勒必须为自己的行为接受法律的制裁。
第3集剧情介绍：假戏真做的历史再现
夏洛克的病情还是没有好转，连乔恩推荐的东海岸最有名神经科专家汉森医生也有些束手无策，只有加大用药剂量。由此带来的副作用就是嗜睡，这是夏洛克不希望的情况。汉森医生认为治疗脑震荡后遗症最佳方法是离开喧闹的城市，到深山老森中寻块僻静之地休养。但夏洛克离不开他的侦探事业，这个提议只得作罢。
警方接到一桩奇异谋杀案，在国家公园举办的历史再现活动中，一名体验独立战争的游客被枪杀。当时大家正在重演独立战争中关键的哈林高地战役，扮演英军的一方被美军游击队伏击。事后大家才发现有人被真正的子弹射中了胸口，当地毙命。警方接报后抵达现场也着实头痛，上百名扮演英军、美军的游客都是目击证人，却提供不出有用的线索，只收集到几条似是而非的目击证词。
死者名叫乔治，是个健身品牌运营商，全国有几百家加盟连锁店。乔恩发现乔治最近从安保公司聘请了保镖，因肤色问题保镖无法在活动中贴身保护，以致发生了意外。可见凶手对乔治的行踪很熟悉，处心积虑的寻找作案时机，终于得手。
从乔治的社交账号和邮箱里可以找到很多威胁邮件，大多是入不敷出的加盟店主。这些言辞激烈的邮件都没有引起夏洛克的注意，因为凶手很有耐心和心机，绝不是那种靠漫骂威胁解决问题的人。夏洛克倒是仔细研究了乔治与其女儿玛茜的来往邮件，玛茜似乎对父亲只顾赚钱不顾他人死活的做法很反感，六个月前就断绝了父女关系，还威胁乔治不许再联系，否则就杀了他。而且乔治死后，玛茜能继承五百万美元的遗产，这个作案动机不得不考虑。
看了一天的电脑，夏洛克觉得头疼如裂，便将剩下的调查工作交给了乔恩和马库斯。他约了互助会的迈克，两人因为都有精力无法集中的经历而结识。迈克就像是夏洛克的担保人，倾听着他的烦恼，让夏洛克能渡过难关。
乔恩查到，玛茜断绝与父亲的关系后变卖了所有家产搬到了一处乌托邦式的公社。在与她的对话中，乔恩和马库斯明显感觉到她对金钱的抵触情绪，即使拿到遗产也会全额捐出。刚从公社出来，马库斯就接到警监葛雷森的电话。一小时前乔治的公寓失火，消防队刚控制火势。看来玛茜的嫌疑排除了，凶手另有其人。
第二天，乔恩从警监手中拿到了消防队出具的报告。系人为纵火，使用了铝热剂和凝固汽油可造成上千度高温。现场没有指纹和DNA，但地面有一处脚印，提取的土壤成分与国家公园的土质相符。乔恩敏锐的察觉现场还少了很多东西，乔治痴迷于独立战争历史，收藏了很多同时代的物品，包括旗帜、文件等。其中还有一套价值25万美元的银器，消防报告中却没有提及熔化的银。
这时夏洛克才匆匆来到警局，服用的药物让他睡了很长时间，乔恩出门时也不忍叫醒他。现在赶到警局，正好参与调查银器的下落。从当铺的反馈很快就查到，有人在打听一套银器的售价，此人就是当晚冲进火场救火的消防队署长科鲁兹。科鲁兹承认当时心生歹念，偷走了现场的银器和保险箱，但拒不承认有事先预谋，更不承认杀害了乔治。从科鲁兹车子的后备箱里，夏洛克和乔恩找到一堆被火熏黑的银器和表面被烤焦的保险箱。如果科鲁兹有预谋，就不会让这些东西被火焰破坏，线索又中断了。夏洛克却有了另一个想法，也许凶手纵火的目标并不是乔治的房子，而是保险箱里的东西。
深夜，乔恩在睡梦中被一阵恶臭熏睡，捂着鼻子跑进厨房，看到夏洛克正拿着锅碗瓢盆炼制药水。夏洛克自制的是水合氯醛，曾被用来恢复烧毁的文件残片。乔治保险箱里没有现金，只有一些文件，但大多因高温变得焦黑。喷洒上药水后，上面的文字显现了出来。其中有三份文件的签名是《独立宣言》签署人之一的巴顿·格威内特，也是现存签字保留最少的人，在签名收藏界里可谓是价值连城的珍品。
收藏界的范围很窄，如果直接毁了签字，乔治必定能猜到是何人所为。因此事先杀人灭口，再纵火烧屋也解释得通。警方把同样收藏有巴顿·格威内特签名的钱伯斯传唤到警局，在乔治的藏品被毁后，他的藏品价值翻了三倍，因此嫌疑最大。审讯室里的钱伯斯直言不讳，承认乔治被害时他就在现场。钱伯斯也是重温独立战争历史的爱好者，痴迷程度不亚于乔治，绝不会放火毁掉巴顿·格威内特的签名。在他看来，这种行径是不可饶恕的罪恶。
乔恩重新审视保险箱里的文件，转换了思路，也许凶手不是为了签名，而是为了文件内容。其他文件都无关紧要，只有一份18世纪八十年代，时任临时总统巴顿·格威内特签发的政府赠地保证书。内容是向参加独立战争的艾伯纳·富勒姆赠予乔治亚州的大块土地以兹鼓励，后因土地丑闻被政府没收。目前，其后代正在向最高法院起诉，要求政府归还该赠地。在看了当前土地所有权人的照片后，夏洛克大吃一惊，正是在乔治被害现场，向警方提供目击线索的游客之一，克里斯。
警方查到克里斯在乔治被害前两周曾有过电话联系，克里斯还购买过步枪并定制枪托，很可能是伪装成燧发枪。但仅凭这两条只够申请到搜查令，对克里斯的公司和公寓搜查过后一无所获，即没有找到凶器也没有找到铝热剂和凝固汽油残留。
在对案件梳理过后，夏洛克和乔恩认定克里斯只有在作案和警察到场的短短十分钟里丢弃步枪，并换回表演用的道具枪。警方早已对现场进行过地毯式搜索，唯一疏漏的地方就是移动厕所里的便池。但距离案发已有两天，移动厕所被所属公司清理，粪便已注入化粪池。要在化粪池里寻找步枪需要几十名警力，而且会让人很难受。
在审讯室里，警方根据夏洛克和乔恩的建议提供了另一个证物，车库里的猫砂。猫砂具有超强的吸附能力，能吸水吸臭，也能吸收空气中的颗粒物质。从猫砂中，实验室化验到微量铝热剂和凝固汽油颗粒，克里斯对此也无力反驳。克里斯还想负隅顽抗，纵火罪顶多判一年。葛雷森警监郑重的警告他，如实认罪还能换取减罪协议。如若不然，等警方从化粪池里找到步枪，只怕会向地检申请最严厉的制裁。
结案之后，夏洛克再次考虑了汉森医生的建议，打算给自己放几个月的长假。此时迈克出现了，手中还拿着一份资料。迈克在一个项目中认识了一个女孩，女孩叫波莉·肯纳，几年中都准时参加互助会，最近却没有再来。迈克递上手中的资料，希望夏洛克能帮助寻找这个不再露面的女孩。
第4集剧情介绍：致命的摇钱树
因为迈克的委托，夏洛克取消了隐居深山的计划，取而代之的是从网上淘来一只上世纪的剥夺感觉箱。漂浮在这种圆柱形的水箱里，完全听不到外界的声音。虽然浸泡了一个晚上，让夏洛克的皮肤发皱，但头疼的确减轻了不少。
对菠莉失踪的调查刚刚开始，纽约警局就发来消息，寻求夏洛克和乔恩的支援。曼哈顿高档写字楼的一家诊所内，一人被捅五十余刀毙命。现场未找到凶器，应当被凶手带走。当赶到现场，乔恩惊讶的发现死者是心理医生坎迪丝。五年前乔恩曾在她的诊所心理治疗，没想到五年后坎迪丝事业有成，建立了自己的诊所却遭遇如此不幸。坎迪丝被害时间是在晚上八点至十点，警方先对坎迪丝的合伙人里欧进行调查。案发时间段里，里欧正在病人家进行心理治疗，这一情况也得到了病人的证实。
有理由怀疑凶手可能是坎迪丝接诊的病人之一，但里欧以医患保密原则为由拒绝提供病历。马库斯只能按程序向法院申请搜查令，夏洛克却没这种限制，悄悄从桌下偷走了坎迪丝的备份硬盘。乔恩拜访了坎迪丝的丈夫并排除其嫌疑回到褐石屋，才发现夏洛克已打印了几千份病历。这完全属于非法行为，乔恩想反对，可也得承认这是破案的最快方法。同时，她还看到坎迪丝医生在病历资料上对她的评定，其中一段坎迪丝认为乔恩寄情于工作是为了掩盖当一个好母亲的本性。仅此一句话，让乔恩对自己的生活有了反思。
从成堆的病历里，夏洛克筛选出最大嫌疑人卡普尔。卡普尔在大型会计事务所工作，因在争吵中咬伤同事，被认为需要愤怒管理治疗。当夏洛克和乔恩赶到事务所进行调查时，闻听噩耗的卡普尔竟然伤心的从三楼纵身跃下。
经抢救，卡普尔保住了性命，浑身包裹着纱布躺在病床上。从坎迪丝对卡普尔的诊断来看，卡普尔属于缺乏信任，在治疗期间会吐露出工作上的细节换取坎迪丝的信任。而且案发时段，卡普尔与老板普莱斯在与客户开秘密会议，没有作案时间。让夏洛克意想不到的是，刚从鬼门关被抢救回来的卡普尔还要工作。事务所老板普莱斯拿着一叠资料进了医院，夏洛克迎了上去，以确认卡普尔的不在场证明。但可以看出，所谓的秘密会议其实就是替黑帮洗钱的会议，难怪卡普尔总是不肯说出细节。
普莱斯并非不关心卡普尔，只是卡普尔对税法的熟悉无人能代替。随后普莱斯还透露，他就是坎迪丝租用办公室的房东，为了让坎迪丝为卡普尔治疗，还免除了她几个月的租金。他记得坎迪丝曾替合伙人里欧支付过几个月租金，还有其他租客多次投诉里欧与坎迪丝发生激烈争吵。看来里欧的经济状况不佳且有所隐瞒，夏洛克决定再去坎迪丝和里欧的诊所。
诊所里，里欧承认自己资金有些问题，但早已连本带利把钱还给了坎迪丝。何况作为合伙人，发生争执也是正常的事，并不奇怪。没有发现可用线索，乔恩便以诊所仍处于警方封锁状态为由把里欧赶了出去。等里欧离开后，乔恩才从拎包里拿出被夏洛克偷走的备份硬盘。她一边责怪夏洛克太莽撞，一边把备份硬盘插回电脑，免得被人发现。
办公室里的日光灯晃得夏洛克头疼，他关闭电源，观察案发现场，突然看到日光灯架下有监听器。如果有人监听坎迪丝医生，那刚才乔恩的话也会被人听到。夏洛克能想到的嫌疑对象只有房东普莱斯，首先他是房东，安装监听器并不困难；其次，他的事务所从事洗钱行为，自然要监听卡普尔是否吐露了什么敏感消息。或许就是普莱斯听到卡普尔说了太多内幕，才雇凶杀了坎迪丝。
在普莱斯的办公室里，普莱斯还想以夏洛克非法偷取现场证物相要挟。但他是坐拥价值十几亿美元事务所总裁，夏洛克和乔恩只是警方顾问。盗取证物不过是坐几年牢，如果让客户知道事务所员工泄密，只怕普莱斯吃不了还要兜着走。两害之下取其轻，普莱斯只得同意让负责监听的人交出录音。
当晚，夏洛克从水箱里出来，就看到事务所雇佣的清道夫克雷站在屋里。克雷并无恶意，他拿出两张芭蕾表演门票，证明自己并没有杀害坎迪丝的时间。而且监听录音已经在警方介入时销毁，他可不想留下违法证据。克雷详细描述了案发当时的声音，八点多时有人进入了坎迪丝的办公室，坎迪丝都没发出呼救声就一刀毙命。此后凶手连续捅了几十刀，期间嘴里还反复发出奇怪的声音。听了克雷模仿的凶手声音后，夏洛克知道那是希腊语，是用于葬礼的词汇，代表“永恒的记忆”。
夏洛克已经想到了真正的凶手，那就是诊所合伙人里欧。里欧是希腊移民，所以才会在杀害坎迪丝时反复说着“永恒的记忆”。连捅几十刀，应当是为了伪装成精神病人作案。至于动机，从卡普尔的病历可以看出端倪。里欧曾替坎迪丝为卡普尔做过几个疗程，发现卡普尔会在治疗时说出内幕消息。坎迪丝保持职业操守，不会以此谋利。里欧却将卡普尔当成了摇钱树，试图据为己有。再深入调查，就能发现里欧提供的不在场证明也有问题。他当晚所说的病人正是一名投资商，二人很可能串通做伪证。
案件是理清了，可并没有直接证据指向里欧。夏洛克心生一计，他和马库斯赶到医院病房。他们将正陪着卡普尔病床边的里欧赶到病房外，以涉嫌谋杀对卡普尔进行讯问。病房外的里欧急得满头大汗，为了保住自己的摇钱树，他离开医院直奔几英里外丢弃凶器的垃圾箱。里欧想找到凶器，然后找个替罪羊帮卡普尔免罪。却不想被跟踪在后的便衣抓个正着，人赃并获，只得认罪伏法。
第5集剧情介绍：价值百万的尸体
乔恩和马库斯在百老汇剧场调查一桩剧评人被害案，死者维多利亚被杀还遭纵火焚尸，百老汇制片人艾尔就是嫌疑人之一。有人曾听到过艾尔与维多利亚发生过激烈争吵，但问讯下来，维多利亚其实是名不良评论人。艾尔因其受贿写剧评而发生争执，最后转账五万以换取维多利亚的好评。
调查下来没有结果，乔恩踏着黄昏的余辉走进褐石屋，却看到夏洛克呆坐在桌前，盯着桌上的背包。夏洛克失去了之前六小时的记忆，只记得去调查维多利亚的私生活，然后就是拎着这背包站在家门口。乔恩打开背包一看，吓得倒退几步，里面竟是一颗人头。
人头明显是经过防腐措施，所以夏洛克不可能是凶手。但出现这种情况，夏洛克只能报警，将人头交警方处理，并向警监葛雷森坦白自己患有脑震荡后遗症的事实。这已经不是夏洛克第一次隐瞒病情了，六年前他被葛雷森聘为警局顾问时就隐瞒了吸毒的历史，曾让葛雷森一度很被动。这次葛雷森没有留情，当即要求夏洛克停职，到医务部进行医疗鉴定。待鉴定结果出来后，由医生决定夏洛克的去留。
没有了夏洛克的协助，乔恩成为调查的主力。从法医处得到的报告显示，人头在防腐前曾摘除过眼角膜，说明他是名器官捐献者。说到器官捐献，乔恩想起两周前维多利亚因车祸烧伤，进行过植皮手术。也许植皮的来源就是那颗人头的所有者，所以夏洛克才会带回人头。
乔恩和马库斯来到为维多利亚做植皮手术的医疗中心，前台的确记得夏洛克来过，针对维多利亚的病历提了很多问题，还调取了另一个植皮患者卡里姆的记录。乔恩对比维多利亚和卡里姆的病历后，发现二人的植皮来源是同一家人体组织库。更离奇的是，卡里姆在维多利亚遇害前两天同样被人杀死在家中，同样遭到纵火焚烧。这样的巧合让乔恩怀疑很可能是供体感染了病毒，人体组织库老板为毁灭证据就对供体进行了防腐消毒处理，并杀害器官接受者焚尸灭迹。
带着这个猜测，乔恩和马库斯来到人体组织库，见到负责人沃斯。沃斯坚决否认供体有任何问题，还声称乔恩的同伴也来过这里，离开时偷走了冷库里的产品。此言一出，乔恩便知是指夏洛克，也证实那颗人头的确来自这里。人体组织库对尸体进行防腐处理并不鲜见，也没证据证明沃斯与谋杀案有关，所以乔恩和马库斯对沃斯拒绝配合调查也很无奈。但人头被偷沃斯都没有报案，其中必有隐情。
现在总算能搞清楚一点，夏洛克偷人头是防止沃斯进一步毁灭证据。马库斯调查了最近签发的死亡证明，也没查到人头的具体身份，调查重点只能转到另一名受害者卡里姆身上。根据病历，卡里姆接受植皮后出现感冒症状，医生寄了一份培养体给卫生部的塞卡斯基博士进行分析。从塞卡斯基博士那，乔恩和马库斯得知一个惊天秘密，卡里姆感染了H7N5高致病禽流感。该病毒只存在于国外，而卡里姆从未出国，只可能是交叉感染所致。同样的病毒报告是六周前三名亚裔居民出国探亲，回来后相继发病死亡。塞卡斯基博士对三人接触的人进行过追踪，确信并无其他感染者。因为维多利亚和卡里姆是接受一名白人男子的植皮，故这三人不可能是卡里姆的病毒来源。
查找供体身份的线索又中断了，乔恩和马库斯只得深入调查死亡的三名亚裔女子。他们发现，其中一名上大学的女子与授课讲师埃里克有秘密恋情，而埃里克的照片正与人头的相貌相符。如此一来，乔恩的猜测再次得到证实，人体组织库将埃里克携带病毒的皮肤提供给医疗中心，发现出问题后，便杀人毁尸。
被传唤到警局的沃斯终于低头承认提供了不合格的供体，并试图毁灭证据，但对谋杀维多利亚和卡里姆的罪名拒不接受。马库斯的另一份调查也间接证实了沃斯的话，埃里克的哥哥都不知道埃里克已经死亡，在人体组织库接收埃里克尸体前两天他们还一起去过酒吧，当时没有任何发病迹象。照理，埃里克应当已进入发病期，如果没有重感冒迹象，只能说明他并有没感染禽流感病毒。
这一情况让乔恩百思不得其解，最后她转换了思路，做出大胆猜测，埃里克是全球首例对H7N5产生抗体的病人，他能在携带病毒的同时自己又不发病。在对人体组织库的往来邮件梳理过后，警方发现提供埃里克尸体的是一名叫佩蒂的代理人。佩蒂与各地的火葬场、殡仪馆有私下交易，购买无人认领的尸体，再伪造捐献同意书出售给人体组织库。但在维多利亚和卡里姆被杀的时间段里，佩蒂正和女友在外地旅游，没有作案时间，他为掩盖自己肮脏勾当而杀人的嫌疑被排除了。
乔恩阅读了一些有关流感病毒的研究论文，其中有一篇提到极度致死感冒病毒幸存者所拥有的抗体可用于研发通用疫苗，而且该论文的作者正是塞卡斯基博士。乔恩脑海里瞬间冒出一个念头，塞卡斯基一定是在对感染嫌疑人员进行追踪时发现埃里克没有出现发病症状。按她的理论，埃里克身体里的抗体能给她带来几百万美元的财富。而要研究抗体必须有埃里克的同意，很可能是被埃里克拒绝后，塞卡斯基痛下杀手，再割取脾脏研发疫苗。她以无名尸体的理由将埃里克送到火葬场，没想到被发死人财的佩蒂私下卖给了人体组织库。之后，她收到了卡里姆的病理报告，知道事情有败露的风险，便利用卫生部的器官捐献追踪系统查到维多利亚和卡里姆的住址，犯下滔天罪行。塞卡斯基博士起初仍想否认罪行，但马库斯申请搜查令对她任职医院的办公室进行搜查，从冰柜中发现了一副脾脏。检测埃里克的DNA只是时间问题，塞卡斯基只得认罪伏法。
乔恩成功破解案情，夏洛克的鉴定报告也有了结果。医务部允许夏洛克临时复职，条件是每周须到医务部检查。葛雷森打心眼里不希望夏洛克带病上岗，但医生做出了鉴定，只能遵守。他警告夏洛克，如果出现任何违反医生规定的事情，夏洛克就永远离开纽约警局。
第6集剧情介绍：核导弹基地里的内奸
葛雷森单独把乔恩叫进了办公室，让夏洛克有此惴惴不安，担心警监还在对他的瞒报行为进行调查。不过夏洛克多虑了，目前葛雷森头痛的是女儿汉娜。汉娜身为警察却染上了酗酒的毛病，虽然参加了戒酒互助会，还领到了三十天戒酒纪念章，可葛雷森总是不放心，所以想听听乔恩在康戒陪护方面的经验之谈。
消除误会后，夏洛克把精力投入到了案件之中。就在昨晚，一所公寓发生火灾。消防队在火场找到一具喉咙被割双手被缚的尸体，由此确定为谋杀现场。经警方检查，死者右手小指缺失了两个指节，估计为日本黑道成员。马库斯从警方资料确认死者为日裔移民，叫安藤东，原极道组成员。但夏洛克从电脑键盘的痕迹上判断，安藤东的右手小指应当有人造手指，现场却没有硅胶留下的痕迹，凶手一定是取走了这枚手指。
要知道那枚人造手指有何蹊跷，就只有找到为安腾东制作手指的伊藤女士。伊藤女士是纽约唯一懂日语的义肢工作者，她对安腾东的事情也有所了解。根据伊藤女士的描述，安藤东是名技术精湛的电脑技术人员，十几岁时被迫加入极道组。在忠诚的服务了十年后，安藤东请求退出，代价就是自切手指。这些情况并不罕见，让夏洛克和乔恩惊讶的是，伊藤女士按要求为安藤东制作了特殊的手指，一枚内置存储芯片的小指。
很难想象存储芯片里有什么内容会让安藤东为之丢了性命，从东京警方传来的消息，安藤东还有另一个身份，就是“总会屋”成员，一个专门从事商业间谍和勒索的地下组织。夏洛克决定先从安藤东的账户入手，从流水明细来看，每个月都三千美元的进项，的确存在勒索金的可能。追查到汇款人叫歾良刚也是极道组成员，或许他不堪忍受勒索才痛下杀手。
夏洛克和乔恩在相扑馆找到歾良刚，他承认每月三千美元是支付给安腾东的赌债利息，但并没有因此杀人。依照极道组的规矩，断指退出组织的人仍在组织的保护范围之内，除非退出者另行从事犯罪行为。所以歾良刚在确认安藤东有违反组织规定的行为之前，绝不会下手。最近，歾良刚在跟踪安藤东时，发现其潜入了一家工业园。他已将照片发送给总部，正在等待总部的指示。
难道是工业园里有什么不可告人的秘密？夏洛克和乔恩顾不上申请搜查令就连夜潜入看似被废弃的工业园，不想里面是空军核导弹秘密基地，二人当场被捕。关押了一晚后，第二天由葛雷森警监陪同夏洛克和乔恩接受军方问讯。空军迪金斯中校了解到相关情况后，承认安藤东确系军方顾问，在为核导弹控制系统提供升级服务。目前核武控制系统使用的是上世纪七十年代的技术，甚至仍在使用软盘。安腾东的电脑技术为系统升级提供了很大的帮助，但因其身份特殊，只能以秘密方式进出基地。在听说安藤东的右手小指暗藏存储芯片，迪金斯中校大吃一惊，无法确定安藤东是否窃取机密资料。为此，军方决定暂时搁置升级计划。
案子查到这里，还是没有凶手的任何线索。这时乔恩拿到了消防队的初步报告，认定火灾并非纵火灭迹，纯属意外。从厨房焦黑的煎锅和食物来看，安藤东被杀前正在烧饭，之后无人看管才引燃了灶具，引发火灾。这就是说，凶手无意掩盖现场，就是要让人发现存储芯片失踪，最大的可能就是想让军方的升级计划关闭。
空军的此次升级计划并未得到所有人的支持，很多人认为目前的系统虽然陈旧，却最安全，黑客根本无法侵入。网络上反对最激烈的是名“自由之树”的博主，从网络追查，此人真实身份是空军阿瓦罗将军，也正是迪金斯中校的上级。葛雷森警监亲自传唤了阿瓦罗将军，但将军有确切的不在场证明。不过他提供了一条线索，目前系统设备的维护商埃迪还有大批设备存货，他自然希望升级推迟，以便清空仓库里的存货。
随后在对埃迪的调查中，警方发现埃迪家里一片狼藉，似遭到袭击。夏洛克从照片里确认埃迪还有艘游艇，果然在码头找到藏身多日的埃迪。埃迪与安藤东相似，也是被人袭击并被束线带绑缚了手脚。但他在网上学过自救法，挣脱束线带后逃脱。他记得自己在公司被打晕后倒在地上，模模糊糊听见复印机的声音。夏洛克查看文件柜，其中有一本有明显搬运过的痕迹，里面是有关埃迪回收旧八英寸软盘的纪录。
这些软盘都是用于空军的核武控制系统，埃迪从各地回收后删除其中的数据，再送到各空军基地。夏洛克通过埃迪的旧设备打开软盘，里面都是克勒克&莱尔公司的账目、库存等信息。该公司并不简单，从上世纪开始就为美联储提供印刷美钞所需的纸张。从该公司反馈来信息，纸钞配方被存在两张软盘中，因公司电脑升级而误作为废品丢弃。由此夏洛克可以推测，凶手很可能是空军人员，无意中发现一张软盘里有纸钞配方，便以这种办法推迟升级计划，争取更多时间寻找另一张软盘。
但到底是谁发现了软盘中的秘密，夏洛克还想不出办法确认。这时消防队传来最终报告，检测出安藤东的煎锅里是辣椒和大蒜。夏洛克灵机一动，想到了办法。次日，葛雷森传唤空军基地相关人员到警局会议室。夏洛克先说明案件的部分案情，说到一半，拿出一盒榴莲吃了起来。在全屋人都捂着鼻子避之不及的时候，只有迪金斯中校没有反应。
迪金斯中校小时候因头部受伤失去了嗅觉，这也能解释她为何没有闻出煎锅里的辣椒、大蒜味道，以至于失火，险些毁了她的计划。而且是她雇佣了安藤东，安藤东必会事先说明手指里的芯片。所以她应当就是得到软盘的人，听说安藤东暗藏芯片的吃惊状只是演戏罢了。可夏洛克拿不出明确的证据，只能任由迪金斯中校离开。
警方虽无法证明迪金斯的罪行，但军方出于安全考虑还是决定撤换迪金斯。迪金斯感觉到自身难保，便偷偷与歾良刚取得联系，愿用安藤东的小指作交换。歾良刚必须确定安藤东没有存储组织的罪证，所以同意提供假护照和五百万美元换取那枚人造小指。但组织的荣耀对歾良刚更重要，没人能杀了极道组的成员而不受惩罚。当迪金斯把人造小指放在歾良刚手中时，相扑馆四周的便衣纷纷亮出了警徽。安藤东小指里的芯片无人能破解，谁都不知道里面到底有什么内容。但它足以证明迪金斯的罪行，让她为自己的贪婪付出应有的代价。
第7集剧情介绍：迈克
汉娜万没想到自己赴约回来后，室友麦迪竟然惨死。麦迪脖子上勒着橡皮管，僵坐在沙发上，凭着警察的敏感汉娜认为这是凶手刻意摆出来的姿势。葛雷森警监随同警察一同赶到现场，安慰伤心的女儿。夏洛克仔细观察过死者后，发现上身衣物名贵，裤子却很便宜，鞋子更是过时货，耳钉明显是死后强行戴上去的。由此来看，凶手有意在向警方挑衅，而且很可能已犯下不只一桩血案。
葛雷森决定亲自参与此案的调查工作。他调来纽约周边警局最近几年的失踪案卷宗，进行并案调查。法医在对死者佩戴的手表进行检测时发现了能匹配的DNA，涉及到一桩五年前的凶杀案。手表属于该案死者艾希莉，只是死者并非失踪，而且已经结案。陪审团认定死者的丈夫格雷厄姆谋杀了妻子，现正在联邦监狱服刑。葛雷森和夏洛克赶到监狱提审格雷厄姆，这些年里格雷厄姆多次提起申诉，声明当时他回家发现妻子尸体时，看到真正的凶手从后门逃离。但地检认为这些都是格雷厄姆用以脱罪的说辞，未予理睬。
这五年时间里，格雷厄姆时刻会想起凶手从后门逃走的场景。也正是这样，反而会产生更多无中生有的细节。他的回忆已不再清晰，只能确定是名白人男性。听到自己有望沉冤得雪，格雷厄姆喜极而泣。他猛然想起两年前，凶手寄过一封邮件，信中承认他不应当承担罪责，并表达了歉意。信在格雷厄姆律师手中，是封打印出来的匿名信，所以同样未得到重视。因未能妥善保管，信纸上已得不到有用的线索，夏洛克只从邮戳看出发信地点是越南。
与此同时，乔恩和马库斯查到耳钉是来自于一家街边小店。这家小店极不规范，别说账簿，就连监控也只保存一周时间。乔恩只得从沿街银行借来最近一年的路面监控，希望能找到佩戴这副耳钉的人。要看一年的监控谈何容易，第二天清晨，乔恩从座椅上醒来时，惊讶的看到本应在水箱中休息的夏洛克正端坐在电脑前。夏洛克看了整夜的录像，以录像的质量根本不可能看出行人佩戴的耳钉，但他确信自己找到了耳钉的主人。
屏幕上出现一名女性路人，正是上个月迈克委托夏洛克寻找的波莉·肯纳。夏洛克亲自来到迈克家，为自己未能把寻找波莉之事放在首位而道歉。在说到波莉可能遇害时，他仔细观察迈克的表情。离开迈克家后，他更加确信迈克就是连环杀手。
迈克委托夏洛克绝非偶然，而是向夏洛克发出了挑战。因夏洛克并未花费多少精力调查，迈克便采用更激进的手段，将线索摆到了警方和夏洛克面前。葛雷森警监没有接受这个天方夜谭式的推测，但当他看到资料中注明的迈克车牌号后大吃一惊，他记得女儿汉娜曾因碰擦事故与该车车主有过接触。
汉娜看过照片后，确认迈克就是前几天碰擦到自己车辆的事主。迈克当时很热情，主动提出赔偿金额，事后还约汉娜吃饭。麦迪遇害当晚，汉娜就是外出赴他的约会，不想他却爽约。从这些事情来看，迈克的嫌疑越来越大，可又没有确切的证据把他与一系列凶案联系起来。
迈克有稳定的工作，同事、邻居对他的评价很高，又无前科劣迹。警方没有理由申请搜查令，夏洛克通过黑客朋友调出迈克的行程记录。记录显示，迈克曾去过越南，日期恰与格雷厄姆收到邮件的日期相符。再做更多对比，就能发现他的行程与很多失踪案对应。但这些都是非法得到的资料，不能成为呈堂证供。
夏洛克说服乔恩，趁晚上迈克外出健身时，对他的住所进行秘密搜查。可迈克像是早有察觉，迟迟未动身。坐在车里的夏洛克感觉到头痛欲裂，却又没带止痛药。乔恩赶忙下车到附近药店买药，回来才发现人和车都没了踪影。
夏洛克在医院的病床上醒来，面前就站在迈克。迈克有意等到乔恩离开，才走向夏洛克。哪知夏洛克一见到他就扑了上去，然后晕倒。迈克说的这些，夏洛克也不知道是真是假，因为他已不记得乔恩离开之后的事。但迈克之后的话，让夏洛克很意外。
迈克直言是他犯下了那些罪行，这一切都源于毒品。他曾是个隐君子，在戒毒时出现强烈的戒断反应。在偶然的机会下，他找到了替代品。策划一起精致的谋杀案，让警方无从破案，那种成就感、兴奋刺激就如同吸毒一般。之后，他愈发不可收拾，屡屡逃过警方调查。但随着技术越来越成熟，那种感觉也越来越无趣。就像需要更多毒品获得满足一样，迈克想提高难度。就在他处理波莉尸体的时候，接到夏洛克打来的求助电话，他便想到利用夏洛克增加这个游戏的难度，此后的事情也正如夏洛克的推测。
迈克敢于毫无顾忌的承认罪行，正是看出夏洛克手里拿不出任何有用的证据。夏洛克不怒反喜，因为迈克无意中说漏了嘴，透露出一条线索。夏洛克还记得自己联系迈克的大致时间，逐一排查当时迈克所在的基站位置，就能找到波莉的尸体。但是迈克始终比夏洛克多走一步，警方只找到一具掩埋在泥土中的假人。看来狡猾的迈克并非说漏了嘴，而是有意为之。
不甘心的夏洛克买来毒品，试图引诱迈克复吸，进而扰乱他的思路。乔恩可不希望夏洛克接触到毒品，她亲自陪着夏洛克守在迈克的门口。眼看着几个马仔敲门，迈克都没有应门，夏洛克相信迈克不在屋内。因夏洛克状态不佳，乔恩独自撬门入室，哪知室内已空空荡荡。
坐在长途车上的迈克打电话给夏洛克，他已离开了纽约。夏洛克的脑震荡后遗症让他的胜利索然无味，所以他要离开纽约一段时间，等夏洛克恢复状态后再回来继续这场游戏。挂断电话后，夏洛克体会到了久违的挫败感。他回到褐石屋拎起行李箱，要去深山休一个长假。
第8集剧情介绍：水泥藏尸
时间过去了三个月，夏洛克精神奕奕的推门进来，脸上充满了自信。隐居生活让他的症状得到缓解，准备和迈克一决高下。这段时间里，乔恩没有放松对迈克的追查，关注每一起失踪案。可自从迈克离开纽约后，就未发生过女性失踪案件，似乎迈克遵守诺言，蛰伏了起来。
纽约警局接到一桩离奇报案，一处建筑工地切割水泥块时，在断面发现了人体切面组织。警方从水泥中凿出完整的女性尸体，经确认，死者叫劳伦，死因为勒脖窒息。从牙齿里残留的尼龙纤维和脖子印痕的宽度，可以确定凶器为汽车安全带。
从死者佩戴的智能手环芯片里查到其工作于一家环保企业，几天前，老板塞林杰曾与她发生争执并将其开除。夏洛克、乔恩和马库斯坐在塞林杰的办公室里，想了解双方产生冲突的原因。原来劳伦是名优秀的清洁科技工程师，两年前塞林杰聘请她加入一项研发项目，默玛计划。项目计划设计一种清洁船，负责自动清除海面油污、垃圾，就像海上的扫地机器人。可劳伦做了一年多的实地调查研究，几个天前通知塞林杰该项目不可行。因此塞林杰将她踢出了项目组，并停职停薪。另外，塞林杰还想起，几个月前劳伦在电话里与一个叫特洛伊的人激烈争吵。
塞林杰的说辞没有不妥，而且劳伦被害时间他有充分的不在场证明，被排除嫌疑。夏洛克检查了劳伦留在公司里的物品，在一件卫衣的袖口发现赭红色油漆，还有一张伤口缝合护理说明书。说明书后附有一张上个月开具的收据，看来劳伦曾受过伤。以收据上注明的诊所地址为起点，夏洛克很快在附近找到一间最近刚刷上赭红色油漆的车库，而这间车库所属住宅的户主正是叫特洛伊。
打开车库大门，本以为能从车辆的安全带上提取到劳伦的DNA。没想到拉开遮挡布，露出来的是一艘默玛船的原型。被带到警局问讯室的特洛伊承认自己与劳伦窃取了塞林杰公司的创意和设计，但劳伦是在安装叶片时被割伤，并非有意伤害。劳伦是个贪婪的女人，想借着默玛项目发笔横财。可塞林杰居然想做成开源项目，让她无法授受。劳伦在一年多的时间里征询过很多专家，得到了不少创意，均被她窃取用于自己研制，还妄图编造谎言让塞林杰放弃研发。这台原型机几天前在哈德逊河上进行过首航，或许是某人发现劳伦剽窃了自己的创意，进而怀恨杀人。
试航过程有录像视频，但不可能看到对岸是否有人在监视。不过，夏洛克注意到，有处河边工地保安以私人土地为由，要求劳伦马上离开。从试航报告来看，该河段存在重金属超标现象，有可能是工地非法排污被劳伦发现，导致杀人灭口。
乔恩前往当地建筑与安全局，调取施工许可证，许可证注明施工单位为黄玉谷工业公司。她还意外从工作人员处得知，几天前劳伦也来调取过该许可证。当天负责招待的人是主管皮克令，他警告过劳伦不要招惹黄玉谷公司。因为曾有蒙面枪手冲入他的办公室，威胁他批准该施工许可。
此时夏洛克正在该河段实地调查，他发现工地已经撤离，并没有建造任何建筑物。从河流堆岸变化来看，黄玉谷并没有排放污水，而是取走了河沙。沙子可用于混凝土、晶片等多种行业，黄玉谷工业公司在河底修建了一条吸沙管道，所以河水才会暂时出现重金属超标迹象。但如此大规模采沙，势必影响到周边桥梁。据检测，桥梁支墩已不稳定，面临坍塌的风险。
再调查黄玉谷工业公司，根本就是家空壳公司，是一个印度黑帮的幌子。其头目叫金达尔，凶残成性，喜好用电钻钻头杀人。马库斯在印度餐馆找到金达尔，他却否认工地违法。金达尔的律师提供了一份建筑与安全局的检测报告，证实吸沙对桥梁并无影响。
检测报告是由工作人员罗密欧签发。当马库斯和夏洛克抵达罗密欧住宅时，发现他双手反绑，头脑上有个血窟窿，早已死于非命。杀人手法符合金达尔的作风，可夏洛克推翻了这种猜测。金达尔是虔诚的印度教徒，视牛为神圣，绝不可能用牛皮制成的皮带反绑死者双手。
对检测报告进行鉴定后，确认罗密欧的签字系伪造。有人伪造签字，还陷害金达尔，又为了阻止吸沙工程曝光不惜杀害劳伦，显然凶手的目的就是要让桥梁倒塌。夏洛克能想到的凶手只有一个人，建筑与安全局的主管皮克令。果不其然，深入调查查出皮克令收受混凝土公司回扣，在桥梁改造工程中使用了未达标的水泥。在拿到黄玉谷公司的申请后，他便伪造检测报告批准施工。只要桥梁倒塌，就能掩盖他受贿的罪证。但劳伦的出现让他心惊胆战，还编造出受人威胁的故事恐吓劳伦。见劳伦不为所动，便杀人灭口。随着夏洛克调查进展，他又杀害了罗密欧并嫁祸金达尔，以免曝露伪造报告的罪行。被传唤到警局的皮克令还想否认，但警方已从他车辆的安全带上提取到劳伦的唾液残留。天网恢恢，皮克令机关算尽，终是躲不过法律的制裁。
第9集剧情介绍：加拉德奖金
生物学教授诺亚被人发现死在了自己的实验室内，死亡时间已有四五天，不仅发生腐败，还被实验用老鼠啃食。因这几天放假，所以没人发现任何异常情况。乔恩在现场，凭着医生的敏锐感觉，从诺亚严重脱发推断其死于铊中毒。
诺亚一向独来独往，对学生很严格，很难说不会有人因为拿了个C而报复杀人。夏觉得这种可能性不大，他在诺亚的办公室搜出一包安非他明，从包裹着的报纸来看，与死亡时间相符。五十片包装的袋子，现在只剩四十九颗，说不定铊就含在被服用的那一颗中。
警方从学生口中查出经常在校内兜售所谓“助学药”的里奇。在警局的审讯室里，里奇大呼冤枉，诺亚是他重要客户，最近还买了一批毒品提神，说是要熬夜开发秘密项目。安非他明里没有检出铊成分，夏洛克查看诺亚的研究资料也没结果，实在想不出凶手的动机是什么。警方倒是在化验诺亚家中食物时，确定铊是被投放在一盒牛奶之中。
这时发生了一件怪，存放犯罪现场老鼠的动物收容所被盗。当晚保安人员听见外面有声响，出去查看，发现有人在停车场燃放烟火。再等他返回，一辆厢式货车从收容所门口加速驶离，那些老鼠也不翼而飞。夏洛克在停车场找到一块女式上衣的袖口残片，显然是在燃放时烟火意外提前喷发，炸伤了作案者的手腕。
调出相应时间的医院记录，遗传学家珍妮被传唤到警局。珍妮承认偷了老鼠，但绝没杀人。诺亚死亡的时候，她还在另一个州开会。至于偷老鼠的原因，完全是为了五百万美元，也就是加拉德奖。
加拉德奖是由加拉德研究所组织，致力于寻找帮助人类摆脱死亡的方法。目前的奖项是奖励能把老鼠寿命延长一倍的学者，之后再是狗、猪，直至人类。一般老鼠的寿命只有一到三年，诺亚却让饲养的老鼠达到了六年的寿命，绝对有资格得到这笔巨额奖金。在他死后，那些实验鼠自然成了一些人觊觎的目标，都希望通过逆向工程，推导出诺亚的研究成果。
夏洛克和乔恩来到加拉德研究所，创始人达德利和他的儿子亨特接待了他们。对于诺亚的死，已头发花白的达德利深感惋惜。他提起诺亚还一个搭档伊莱加，夏洛克感觉很奇怪，调查工作持续到现在，都没人提到过这个伊莱加。
从警方的资料来看，伊莱加果然不是善茬，有暴力伤人前科，名下还有多支步枪。为防意外，马库斯调来武装人员搜查伊莱加的屋子，却发现伊莱加倒在厨房的地板上，已死亡一周以上时间。伊莱加死于重物打击，凶器应当是被丢弃在现场的擀面杖。厨台上散落着细微的普鲁士蓝颜料。夏洛克和乔恩都很清楚，这种颜料是铊的解毒剂。看来凶手原计划投毒，作案时被伊莱加撞破，于是随手抓起擀面杖杀人。
厨房的冰箱上有一滴残留血迹，经化验并非来自于死者伊莱加，而是属于一名十五岁的高中生蕾西，这让夏洛克和乔恩感觉到很不可思议。来到蕾西家，他们才知道伊莱加还有份地下工作，出钱收集年青孩子的鲜血，再高价注射到老年人体内，以此盈利。几个月前，蕾西前去卖血时，看到伊莱加在家门口与一人发生争执相互推搡。自那以后，她就再也不敢去伊莱加家了。
从蕾西的手机上调出伊莱加与人推搡的视频，并没有拍到对方的正面。不过夏洛克从唇语读出，伊莱加在叫嚷着“雨果”的名字。乔恩也发现此人外套下的衬衣是紫橙相间，只有一家连锁餐馆的工作人员才会穿这样的制服。以此为线索，马库斯找到并把雨果带到了审讯室。
雨果是名基要主义者，得知诺亚和伊莱加的死讯后，毫不掩饰欣喜之情。在他看来，这些人改变自然规律，是对上帝创造物的侮辱。虽说如此，在伊莱加死亡的时间段里，雨果正在餐馆上班，有监控为证。夏洛克把视线转向雨果经常登陆的论坛，这些基要主义者聚集在论坛里，说不定就有某个狂热份子杀了诺亚和伊莱加。
通宵查看后，夏洛克发现一个网名“普拉普”的人在论坛提供了大量信息，包括参加加拉德奖的科学家名单，他们的地址以及研究进度，还煽动论坛里的人去消灭那些亵渎上帝的人。但从论坛里的回复来看，人们拒绝了这个极端的提议，或许普拉普因此自己动了手。
根据IP地址，很快查出“普拉普”就是加拉德研究所的现任管理者亨特。调阅研究所最近几年的财务报表，年迈的达拉德把资金过多的投入到研究长生不老的项目中，逐渐入不敷出。达拉德眼活不了几年，亨特眼睁睁看着将来的遗产越来越少，就想出这种办法，妄图破坏比赛。诺亚和伊莱加取得决定性成果后，他便利用自己掌握的知识投毒杀人，欲保住那五百万奖金。
这一切听起来合情合理，却没有关键证据。夏洛克想起第一次见到亨特时，他总是不经意的用手摩擦指甲，而且指甲非常短，像是刚刚胡乱的修剪过。马库斯调派人手翻找加拉德研究所的垃圾桶，从中找到了几枚染有普鲁士蓝颜料的指甲碎片。亨特在杀死伊莱加时指甲沾到了这些颜料，夏洛克和乔恩来访之时还没褪色，他只好匆匆剪去，却正好成了杀人证据。
第10集剧情介绍：赝品
哥哥麦考夫离开纽约已经有两年时间，夏洛克在这段时间里经历了很多事，也看开了。兄弟没有隔夜仇，可当他打听哥哥下落时才知道，麦考夫在半年前就因白血病过世，葬在新西兰基督城外的一座墓园里。父亲莫兰德闻讯赶到了褐石屋，内心悲痛。麦考夫是他遗嘱中唯一的继承人，这一点他不怕夏洛克知道，如今只能修改遗嘱。莫兰德会在纽约呆一周时间，办理遗嘱的相关手续，也希望趁这个机会，弥补与夏洛克的间隙。这时，马库斯的电话打断了父子俩的对话，莫兰德识趣的离开。
三个在地下废弃辐射避难所探险的年青人，发现了一具无名女尸，还看到有人从女尸旁仓皇逃走。但因嫌疑人带着防毒面具，面容看不真切。死者已死亡几天时间，除了大腿上割断动脉的致命刀口，其他刀口都有些怪异。夏洛克立马看出来，这些刀口是用于取出死者内脏，然后把内脏放到一旁的陶罐内。再加上陶罐旁的蜂蜜、香油，这分明是制作木乃伊的古老方法。
木乃伊在文物市场价值千金，自然会有人制造赝品谋取暴利。葛雷森警监找来了有过多次合作的老朋友，埃及文物鉴定专家豪斯曼教授，教授从现场收集的护符判断嫌疑人是在伪造一位三千年前的女法老木乃伊。他认为这只是普通的文物案，不会涉及到谋杀。类似的赝品都是从医院停尸房或殡仪馆非法盗来的尸体。可夏洛克不这么想，历史上女法老死于侄子的刀下，正是死于大腿动脉断裂失血。伪造者务求还原历史，就必然会以活人为目标。
古埃及人惯用寇斯派弯刀。马库斯查到最近有把弯刀邮寄到了一家搏击训练营，他和夏洛克赶到训练营调查，在与负责人交谈时，一名教练紧张的盯着马库斯。教练名叫布莱恩，被带到警局后主动交代了自己的罪行，以换取减刑。他只是受雇杀人，一个代号“底比斯人”的神秘人会把要求，诸如年龄、种族、身高、性别告诉他，他就按要求寻找目标并以规定的方式加以杀害。完事后，他把尸体藏匿起来，通知“底比斯人”取物。布莱恩已做过四次案，却从没见过“底比斯人”本人，都是通过一次性手机交流。
根据布莱恩的交代，这次被害者叫米莎，是名平面设计师。夏洛克端详着米莎生前的照片，心里起了疑问。虽说米莎有点中东血统，但绝不像埃及人，而且身高比历史记载的女法老高得多。看来“底比斯人”选择米莎另有目的，就是雇凶杀人。
夏洛克调看了米莎的个人资料，并没找到她与人有仇。乔恩倒是从银行流水中发现一年多前，米莎聘请过律师，五个月后收到一家拍卖行的七万五千美元支票，之后又陆续收到几笔支票。夏洛克把这件事交给了乔恩，他还有其他事要处理。乔恩和马库斯便来到拍卖行，查到该拍卖行负责人维内托的确支付米莎七万五千美元，用以和解性骚扰的官司。但维内托不承认与米莎被害有关，实际上他已取得了米莎的谅解。之后签出的支票，不是米莎敲诈，而是米莎为拍卖行设计拍卖目录所得的稿酬。马库斯翻看了设计精美的拍卖目录本，似乎并没有什么破绽。不过维内托想到了一个人，米莎的前任里奇，两人分手的时候并不友好。而且里奇还欠了米莎两万美元，完全有杀人动机。
里奇被传唤到警局，得知米莎惨死后很伤心，她心里还深爱着米莎。至于那两万美元欠款，几个月前就已销账。当时米莎正忙于写一本书，内容是有关一个叫“范·福欧”的名画伪造者。米莎要揭开这些赝品的真相，而里奇有个特殊本领，能从画作笔刷的笔触判断画作的真正作者。米莎利用里奇的本事找出在艺术品收藏界里流传的“范·福欧”赝品，以此抵消债务。米莎的下一步就是要揭发“范·福欧”的真实身份，也许正是因此丧命。
乔恩调查了里奇所说几幅赝品的来源，又调查了作画原料来源，都没有发现指向“范·福欧”的线索。正发愁时，夏洛克一脸严肃的走进了褐石屋。今天他在律师楼拒绝继承父亲的遗产，从律师楼出来等车时，他发现有人在跟踪父亲。莫兰德目前是大型集团总裁，国际问题顾问，还秘密控制着莫里亚蒂的组织，任凭哪一项都有可能招来杀身之祸。但夏洛克没有提醒父亲，以免打草惊蛇。
听到乔恩的调查工作毫无头绪，夏洛克觉得是乔恩找错了方向。范·福欧制作的赝品，其画布、画框并非来自现代，而是使用了那些便宜的，不出名的古画作。在古老画布上仿制名画，才更容易迷惑人。顺着这条思路，夏洛克和乔恩找到了籍籍无名的画家韦尔斯。
韦尔斯得知米莎的死讯后简直悲痛欲绝，因为米莎是他的私生女。韦尔斯是为了抚养母女俩，才投身赝品行业。米莎写书的目的不是为了揭穿韦尔斯，而是为了证明韦尔斯就是大名鼎鼎的“范·福欧”，是最伟大的伪造师。但艺术品收藏界龙蛇混杂，有为了爱好收藏的，也有为了洗钱的，其中不乏黑帮、恐怖组织。韦尔斯不希望女儿卷入这个泥潭里，没想到米莎还是丢了性命。
韦尔斯倒是听说过“底比斯人”，可没人知道他的真名。坊间有传闻，“底比斯人”有种特殊方法，能骗过碳14年代测定。韦尔斯说得煞有其事，夏洛克和乔恩却知道绝不可能。碳14同位素测定是建立在放射衰变基础之上的，没人能加快放射衰变率，否则切尔诺贝利和福岛核电站的辐射残留一夜之间就能清除。这种违反物理常识的传言只可能是“底比斯人”自己散布出来，目的应当是为了掩盖其真正的手段，贿赂鉴定人。
韦尔斯知道几个“底比斯人”制作的赝品，巧合的是这几件赝品的鉴定人都是葛雷森警监的老朋友豪斯曼教授。待葛雷森要联系豪斯曼时，才知道豪斯曼教授清晨遛狗时，在公园遭遇枪击，送医不治。
法医在尸检时发现豪斯曼的肺部有淤痕，乔恩知道这是长期吸入硫化钾的症状。硫化钾可用于制造铜绿，是做旧的常用手段。看来在避难所戴着面具逃走的人就是豪斯曼，豪斯曼就是“底比斯人”。对豪斯曼银行账户调查也证实了这一猜测，有个海外账户汇钱给豪斯曼五万美元，豪斯曼又将钱转到了布莱恩的账户。看来豪斯曼雇佣布莱恩杀死米莎，最后自己也被幕后黑手杀人灭口。但有件事很费解，一般收藏者要么收藏名画，要么收藏古董，很少有交集。幕后黑手却名画、古董均有涉猎，很可能他并不是收藏家，而是中间商。
韦尔斯按夏洛克的要求，在行内宣称将金盆洗手，只需五百万就能拿走他所有的赝品存货。不少中间商闻风而动，可只有拍卖行负责人维内托引起了警方的注意，因为他支付五百万的账户，与汇款给豪曼斯的海外账户账号一致。贪心的维内托通过拍卖行出售了不少赝品，如果让那些人知道真相，只怕小命不保，因此才设计杀害米莎。
案子破了，夏洛克也从军情六处得到情报，跟踪莫兰德的人叫万尼亚·博罗扎，是赏金杀手，“精算师”丹尼尔·戈特里布的高徒。晚上，夏洛克会同军情六处将万尼亚堵在了酒店房间里。见无处可逃，万尼亚纵身跳出窗户，宁死也不说雇主的姓名。莫兰德听说此事后，沉吟片刻。他早预料到会有这么一天，只是没想到来得这么早，莫里亚蒂终究还是回来了。
第11集剧情介绍：走私香烟中的腐败
乔恩一接到马库斯的短信就匆匆赶到了现场，奇怪的是，一向积极的夏洛克却没来。死者叫吉尔伯特，是大型会计师事务所的查证部副部长，从事合并项目的账务审查。邻居是看到门口的匹萨放了很长时间，才想到报警。匹萨站老板确认吉尔伯特是店里的常客，前天晚上九点亲自打电话下的订单。现场值钱物品丢失，貌似入室抢劫，但乔恩看到被打碎的厨房门玻璃就知道有人伪造了现场。碎玻璃洒了一地，却没有被门推开，分明是凶手行凶后从外面打碎门玻璃，却没有开门进来。进一步勘验现场，死者手腕上有淤青，电脑前的座椅扶手上有刮痕，可见死者是被铐在椅子上。至于凶手的动机，应当就在电脑里。
而这会，夏洛克正和父亲莫兰德面对面坐在沙发上。莫兰德很清楚，天底下没有人比夏洛克更熟悉莫里亚蒂。既然莫里亚蒂已然出手，莫兰德也不愿坐以待毙，想请儿子先下手为强，解决莫里亚蒂。对莫里亚蒂有着特殊感情的夏洛克没有当场答应，但他还是赶到英国秘密情报处。副处长沃尔特爵士欠了夏洛克不少人情，把万尼亚的遗物交给夏洛克也就不是什么难事。
次日，调查吉尔伯特电脑的工作人员有了线索。当晚，吉尔伯特向公司提交了一份审计报告，同意亚什本烟草公司对峰存烟草经销商的收购。是亚什本公司的负责人奥尔多雇佣了吉尔伯特审查峰存公司的账务，或许有人胁迫吉尔伯特发送报告，以促使收购完成。
夏洛克和乔恩跟着马库斯来到亚什本公司，打断了合同签署仪式。与收购有利益关系的峰存公司总裁罗威尔等四人当场接受警方询问，证实他们案发时都远在俄亥俄州的阿克伦市。夏洛克发现身为总裁的罗威尔却是看着一旁销售经理提姆的眼色说话。从亚什本公司出来，夏洛克交待马库斯和乔恩着重调查提姆。说完，他就忙着去处理自己的“家事”。
乔恩调查提姆的资料，没找到可用的线索。法务会计对峰存公司的账务进行调查，也没有任何可疑之处。在查看吉尔伯特的报告时，乔恩发现吉尔伯特还调查了峰存公司的货运码头记录，认为货运量超出公司的现金流量。记录显示峰存公司从俄亥俄州购进、到纽约州售出一万箱香烟的同时，还另外挟带一万五千箱。这部分香烟没有销售记录，涉嫌跨州走私。
俄亥俄州的烟草税率远低于纽约州，自然也成为走私犯眼中的肥肉。如果提姆从事走私活动，便有了杀人动机。正巧，缉私处最近刚从布鲁克林格林堡附近查获一批走私香烟。乔恩闻着香烟外包装上味道不同，想起了夏洛克的一个老朋友“鼻子”。
晚上，从万尼亚的交通卡追查到一处租用仓库后，夏洛克回到了褐石屋，进门就看到“鼻子”在闻几条香烟。夏洛克跟乔恩简单讲了一下，在仓库里没有找到有价值的线索。不过仓库桌上堆放着几袋未开封的咖啡豆，收据上所写的咖啡店很有可能是万尼亚与莫里亚蒂的联络地点，买咖啡豆只是掩饰。正说着，“鼻子”有了结论。香烟包装上有松木、八角茴香、西柚和啤酒花的味道。查看地图，格林堡旁有家酒窖，就是工艺啤酒厂。
马库斯不敢怠慢，连夜组织人手清剿走私窝点。但刚要下令就接到警监葛雷森的电话，要求取消行动，并回警局办公室。回到警监办公室，马库斯诧异的看到提姆就坐在葛雷森的对面。提姆真名巴克西，是烟酒火器管理局的卧底探员。烟酒火器管理局主管霍布斯亲自到警局说明情况，巴克西已卧底峰存公司三年，与另一名探员埃文涅尔里应外合，试图找到走私渠道。峰存公司总裁罗威尔知道此事，吉尔伯特查到的一万五千箱走私香烟也是卧底行动的一部分。
烟酒火器管理局不可能为了一次卧底行动就杀人灭口，但罗威尔从并购中受益颇丰，仍不能排除嫌疑。罗威尔为了自证清白，特意从俄亥俄总公司叫来办公室主管玛姬，向警方展示所有交给吉尔伯特审查的资料。玛姬当着马库斯和乔恩的面打开笔记本电脑，除了账务资料外，还有装卸货品的监控视频。其中可以看出，巴克西每完成一次交易，过不了几分钟埃文涅尔探员就会到场。他开着豪车，身上的行头价值不菲。再看看巴克西，同样是名鞋名表。按规定，这种走私交易所得钱款应当上交国库，看来巴克西和埃文涅尔并没有认真执行这条规定。
调查之余，夏洛克抽空来到咖啡店，墙上的一幅画引起他的警觉。这幅画是莫里亚蒂的作品，可见咖啡店就是莫里亚蒂的老巢，这一点无庸置疑。夏洛克让女招待传个话，要求与莫里亚蒂见面。
从咖啡店回来，夏洛克边等回音，边查看监控录像。这段时间里，乔恩也大致计算出巴克西在峰存公司三年从事的走私活动足有三千万美元的进账。烟酒火器管理局回应，他们知道这笔钱款，授权巴克西和埃文涅尔代为保管，直至卧底行动结束。夏洛克正在考虑吉尔伯特是否因查问该笔非法基金而招致杀身之祸时，马库斯传来消息，巴克西和埃文涅尔出事了。
巴克西和埃文涅尔双双中弹身亡，有目击者称，枪击现场只有这两人，他们像是在激烈争吵，其中一人高喊“不是我”。法医的弹道检测报告也证实二人体内的子弹均来自对方，可以判断是发生了内讧。在埃文涅尔手机里，警方查到一条转账信息，两千六百多万美元被转至海外账户，这应当就是二人争执火并的起因。
调出银行流水，夏洛克发现在吉尔伯特审查账务的前几个月，就有人以小金额多次从该非法基金账户中转账至海外，像是在测试巴克西和埃文涅尔的反应。到二千六百多万全部被转走前，已陆陆续续划转了三百多万。还有几笔是在巴克西卧底一年后开始，汇到国内几座城市。葛雷森看到几个城市的名字，就明白了，这几个城市都有烟酒火器管理局的常驻办公室。由此说明，知道该非法基金的不止霍布斯、巴克西和埃文涅尔，还有其他探员。
划到国内银行的几笔，事前巴克西都接到过主管霍布斯的电话。被传唤到警局的霍布斯承认擅自动用了该基金，但目的不是贪污，而是绕开向国会申请资金的程序，加快侦查的效率。不过他在与巴克西和埃文涅尔接触时，经常会听到有个外号“斗牛犬”的人，在帮助处理基金账目。
乔恩心中猛然一怔，她想起峰存公司主管玛姬的电脑桌面就是她与家里两只斗牛犬的合影，而且玛姬也的确了解卧底行动。据查，玛姬已与罗威尔搭机回了俄亥俄，刚出机场就消失不见。玛姬在下飞机后，打给夏洛特市的某个一次性电话。随后机场监控拍到她进入了私人航空通道。另外，烟酒火器管理局常驻夏洛特市的探员，从一年半前开始效率降低，恰好与玛姬入职峰存公司的时间相符。
亚什本公司总裁奥尔多被传唤到警局后，坚决否认知道烟酒管理局的卧底活动。可夏洛克已调查出完整的证据链，玛姬在入职峰存公司前是在总部位于夏洛特市的亚什本工作，她失踪的那天，亚什本名下子公司的一架私人飞机从夏洛特机场起飞。玛姬根本就是奥尔多派去峰存公司的眼线，以维护其占了大半利润的走私渠道。在吉尔伯特被害当晚，玛姬也拔打过那部一次性电话，之后奥尔多陪同玛姬往返纽约，时间与吉尔伯特被害时间相符，这一点机长可以作证。葛雷森给了奥尔多提议，只要指证玛姬犯下的罪行，就能减轻被缉私局处罚的力度。
案件告破后，夏洛克方有时间把父亲莫兰德请到褐石屋。就在昨晚，夏洛克与莫里亚蒂派来的女招待艾洛莉见了面，并达成休战协议。莫兰德对儿子能找到莫里亚蒂并不觉得吃惊，让他想不通的是，莫里亚蒂为何甘心放弃复仇计划。原来，夏洛克声称如果莫兰德意外身亡，他就会接替父亲继续掌管组织。这是莫里亚蒂不希望看到的，因此她同意了休战协议，时限到莫兰德寿终正寝。在那以后，夏洛克要独力对抗莫里亚蒂和她那邪恶组织，赢得真正的胜利。
第12集剧情介绍：情侣黑枪手
乔恩的妹妹玲介绍了一个客户克拉里先生。克拉里是当地有名的房地产经纪人，家境殷实。可他却想寻找一个素未谋面，只在网上有过交流的女孩玛丽亚。玛丽亚已经四天没在网上出现，最近写给克拉里的私信里声称要处理一些麻烦事，但没有细说到底是何事。乔恩第一反应就是玛丽亚可能是在行骗，以有困难为由向男网友索要钱财。克拉里不这么认为，他主动写信要汇款，玛丽亚一直没有回复，可见并非乔恩所设想的那样。
乔恩从人口记录中找到玛丽亚的住址，上门发现果然出事了。门口有血迹，屋内凌乱，后门还有两组脚印，其中一双12码的鞋印明显是男鞋。现场的钱包和现金都没少，还有一堆礼品卡也没动。种种迹象表明玛丽亚被人绑架，乔恩立刻打电话给马库斯报案。
警方联系了玛丽亚的哥哥丹尼和姐姐凯特，他们不清楚玛丽亚惹上了什么麻烦，也没人前来索要赎金。玛丽亚一年只与姐姐见几次面，最近见面玛丽亚坚持付账，而且都是使用礼品卡。每次问到礼品卡的来源，玛丽亚总是讳莫如深，一笑而过。
夏洛克想到在玛丽亚的家里，除了桌上摆放着各种手工焊接的小玩具，还有高清摄像头，衣柜里有几件昂贵的性感内衣。可以推断，玛丽亚是女主播，收取粉丝寄送的礼品卡和代金券。起初的调查印证了夏洛克的想法，可进一步调查下去，夏洛克发现玛丽亚不仅是女主播那么简单。她有自己的网站，绰号“金钱女王”，是名金主。在视频中以威胁和哄骗男观众即“金奴”寄钱或礼物，是种你情我愿的敲诈勒索。而克拉里早已知情，因为他就是付钱最多的金奴之一。
夏洛克不认为克拉里会为了讨还钱款而起意绑架。乔恩把克拉里叫到了褐石屋，而不是警察局。克拉里老老实实的承认自己有妻子有工作，不想让别人知道他有这种怪癖嗜好，因此才向乔恩隐瞒了实情。而且玛丽亚邻居的证词，证明绑架发生在周六晚十点左右，当时克拉里正在参加公司聚会，玲也能作证。
克拉里想起玛丽亚曾说过有人在网站留言板上发帖怒骂，花费了所有大学基金仍被玛丽亚拒绝。其他会员纷纷跟帖起哄，建议楼主找出玛丽亚的地址并实施绑架。该网站的名字叫“送你黑药丸”，虽然夏洛克没听说过这个网站，但熟悉“黑药丸”的名字。那是一帮单身狗把自己独身归结为女性阴谋的极端叫法，往往与厌恶报复女性相关联，看来玛丽亚的处境不妙。
夏洛克和乔恩在一家咖啡店找到“送你黑药丸”网站的管理员阿特。肥肥胖胖的阿特可不想为了会员的言论招惹上国安局，很快就提供了发贴人的真实姓名凯尔。发布全境协查通告后，高速公路巡警拦截下凯尔的车辆，在副驾驶座位和后备箱里找到多把枪支及大量弹药。根据手机导航，他正前往一家女性健身房。然而凯尔声称他做这一切都是为了证明自己有多爱玛丽亚，只因为健身房涨价导致玛丽亚不得不退出会员，凯尔就要杀人报复，视人命如草芥，乔恩想想都觉得后背发毛。
被押回警局审讯室的凯尔仍对失踪的玛丽亚念念不忘，他还知道周六晚上，应当是玛丽亚旅行回来之后。每年的固定时间，玛丽亚都会到几个固定城市去旅行。乔恩觉得玛丽亚是在与金奴私下见面，可调查下来，并没有金奴在那几座城市。
结合路线和日期，乔恩查出来玛丽亚是在追随一个巡回手工魔力展，也许是在展会上出售自己制作的小玩具以换取额外收入和认同感。夏洛克和乔恩找到展会主办方，他们对漂亮玛丽亚印象深刻。同样也是因为漂亮的外表，会招来参观者，还有其他摊主的骚扰。有一个摊主罗曼就经常在玛丽亚的摊前晃悠，他本身是名手艺高超的铁匠，现场锻造精美的匕首和刀具，能吸引不少观众。巧合的是，罗曼和玛丽亚同样没来参加纽约站的展会，嫌疑陡升。
马库斯赶到罗曼家，发现屋内一片狼藉，后院有三双鞋印和一双光脚的脚印。鞋印和脚印一直延伸到后院锻造间，锻造间里的几台设备被拆走。由此推断，罗曼非但没有绑架玛丽亚，反而是另一名受害者。
罗曼房间里到处都是他与玛丽亚的合影，俨然是对情侣。在沙发下找到了罗曼的手机，他与玛丽亚的短信聊天大多是卿卿我我。可最后几条他们却像是要脱离什么组织，语气显得非常紧张。
在锻造室的垃圾筒里，夏洛克找到一些金属锻压后剩下的飞边。把飞边拼接起来，显出手枪的轮廓。玛丽亚和罗曼在暗中制作没有序列号，没有购买记录的黑枪，这种枪在黑市可卖到上千美元。嫌疑范围一下就转移到了街头商贩和黑市批发商，只是人数太多，不可能一一调查。
恰好葛雷森警监手里有份烟酒与火器管理局发来的协查通告，查找这两年泛滥东海岸的黑枪源头。烟酒火器管理局已逮捕近百名使用黑枪的罪犯，可他们没人愿做告密者。夏洛克仔细翻阅这些罪犯的资料，寻找到突破口。
为了不让协助藏匿五万美元的情人受牵连，一名银行抢劫犯透露出贩卖黑枪的上家名叫恩里克。但是在抓捕过程中，恩里克持枪顽抗，被特警队击毙。唯一的线索中断，夏洛克看到尸身前臂上有“窃贼帮”的纹身，心里有了答案。“窃贼帮”是一伙摩托车黑帮，无恶不作。玛丽亚哥哥丹尼的手臂上也有相同纹身，最大的可能性就是丹尼让妹妹与妹夫从事这一勾当，在玛丽亚和罗曼决意退出时，他便反脸无情。彻查窃贼帮，找到玛丽亚和罗曼只是时间问题，审讯室里的丹尼主动交代了二人的下落，只求换取减刑。
第13集剧情介绍：离奇自杀案
乔恩很想领养一个孩子，已向领养机构提出申请。她的代理律师盖瑞与机构联系后，通知了社工前来家访的时间。在这件事上，夏洛克积极配合，还特地把褐石屋里那些与罪案有关的东西都收了起来。但社工并没有按时家访，联系了领养机构，乔恩才发现自己因为没有参加亲子活动而被拒绝。是律师盖瑞工作失误，才导致乔恩的申请被驳回。因盖瑞与领养机构合作多年，乔恩处于劣势，只得自认倒霉，忍气吞声等几个月后再重新申请。夏洛克看在眼里，打算替乔恩解决此事。
正说着，马库斯发来消息，发生了一起命案。二人来到弗里斯克大楼，死者正是大楼的主人利兰，一家安置公司的老板。利兰的工作就是协助其他公司驻外地员工相关饮食起居和家庭生活的安排，深夜时被清洁工发现一动不动的趴在办公桌上，死亡时间在晚上八点至十点之间。夏洛克看到桌上有瓶沙克特拉酒，这是一种甜点酒，只在意大利生产，美国很少见。瓶口散发出淡淡的杏仁味，一定是加入了氰化物。在盛放酒杯的托盘上还有另一只湿杯子，说明有第二人在场，而且还清洗过杯子上的残留物。鉴证组已提取到两组不完整的指纹，等待进一步匹配。
服用氰化物非常痛苦，乔恩想不通为何要这样对待一名安置专家。她很快就得到了答案，凶手还闯入了公司的档案室，从档案室里众多资料来看，利兰并不简单。档案室里有很多公司客户的资料，可以追溯到八十年代。马库斯认为利兰用这些资料敲诈勒索，才遭到杀身之祸。凶手杀人后闯入档案室，是为了取走自己的罪证。
夏洛克却不这么想，档案里很多人名都在这两年的新闻里出现过，均被怀疑是因为商业竞争或其他原因遭暗杀，但没有一件被起诉。利兰保存这些资料，不是为了勒索，而是一种保障，防止客户背叛。夏洛克边说边撬开档案室深处的一个小门，露出里面的枪械库。
把档案室里的资料梳理了一遍后，夏洛克确认里面涉及到很多权贵家族内的不明死亡事件。安置专家只是幌子，利兰真正的身份是职业杀手。这些档案能帮助警方破获很多悬而未决的案件，而要找到利兰被杀的原因，就需要找到编号中缺失的那一份。
从档案里整理出的一系列谋杀案中，有两件是由同一名联邦探员科纳负责，她也是第一个进行合并调查的人。乔恩与科纳接触后，才知道这两起案子的目击证人都说现场有名高个子，留山羊胡须的人出现，这正与利兰的特征相符。乔恩觉得可能是科纳的调查让利兰的客户有所察觉，才杀人灭口。警监葛雷森也觉得不能排除这种可能性，便要求科纳提供调查名单。
同时，夏洛克和马库斯找到了利兰的助手雪莉。雪莉不敢相信为之工作了15年的老板会是名职业杀手，从她电脑里的档案编号，马库斯查到缺失资料的客户名叫卡尔。卡尔拥有一家制药公司，不开发新药只买生产权。经常是低价收购生产权，然后抬高药价，招致病人不满。
马库斯、夏洛克和乔恩拜访卡尔，豪宅里四处可见保镖，看来他的肮脏生意没少给他招来麻烦。卡尔虽然否认认识利兰，但利兰被害现场酒杯上的一组指纹与他的指纹匹配。而且夏洛克还从卡尔的酒窖中找到与现场那瓶相同生产商、相同批次的沙克特拉酒。不过，在利兰被害时间段里，卡尔正与女议员丽兹在一起。就算卡尔是丽兹的金主，丽兹有包庇的可能，但仅凭一枚残缺指纹就想让地检立案，基本没有可能。
夏洛克想出倒查卡尔雇佣利兰所做的案子，查清一件受害人未知的谋杀案。从雪莉提供的行程安排，可以知道谋杀案是发生在2014年9月18号至20号的匹兹堡。同年卡尔收购了三氟噁唑的营销权，这种用于治疗罕见慢性遗传病的药物原本价格低廉，收购后涨至上千美元一片。在该疾病研究领域里，只有研究员彼得对卡尔造成威胁。他宣称找到更廉价的新疗法，但2014年9月在匹兹堡参加研究会议时，被人发现死于酒店房间里。当地警方在他的气管里发现薯条，身上也无暴力伤，就定性为意外窒息死亡。
夏洛克在彼得的尸检照片上发现异常，彼得嘴唇四周有淤青，这是一种叫做“梦魇”的凶器所致。将氧气面罩与打气筒相连，就能快速抽出肺部空气致人死亡，嘴唇上就会留下这样的淤青。而利兰的枪械库里，恰好就有这么一件凶器。
但在餐厅找到正与客户吃饭的卡尔时，夏洛克对自己的推断有了怀疑。卡尔对喝酒的要求很高，喝开胃酒与甜点酒要使用不同的杯子。利兰被害现场那只湿杯子却是个普通酒杯，并不适合饮用甜点酒。夏洛克多了个心眼，请卡尔提供平时常去餐厅的清单。在这些餐厅的侍者里，果然找到了另一组指纹的所有者。湿杯子根本就是从餐厅偷的，目的就是为了陷害卡尔。
餐厅监控显示，是利兰偷走了卡尔使用过的酒杯。再进一步调查酒水店的监控，显示在卡尔购买了沙克特拉酒后没几分钟，雪莉就来到柜台，而且向营业员要求购买与卡尔相同生产商相同批次的酒。雪莉涉嫌帮助利兰栽赃卡尔，当看到雪莉的儿子躺在床上，痛苦的呼吸着三氟噁唑时，夏洛克差不多都明白了。
孩子是雪莉和利兰所生，一生下来就被病痛折磨。卡尔毫无人性的提升药价，让利兰很愤怒。出于职业敏感，他觉得彼得的死有蹊跷。调查下来，他发现连公司董事会都对卡尔的行为不满，如果卡尔被踢出董事会，其他董事就会恢复药价。利兰便想找机会揭穿卡尔，让他为杀害彼得入狱。但是科纳的调查步步紧逼，利兰所剩时间不多，他便索性自杀，将警方的注意力转向彼得之死。利兰从未受卡尔雇佣，枪械库里的“梦魇”也是几周前做的，目的就是为了诱导警方。
一个杀手赔上性命，要让不良奸商降低药价。夏洛克从雪莉手里拿到利兰调查彼得被杀案的所有资料，决定替他完成未尽的任务。当然，在这之前，夏洛克把波西米亚世袭国王尔施泰因大公请到了褐石屋。这位没有国土的名誉国王欠莫兰德很大的人情，对夏洛克的邀请也不便推辞。夏洛克查到大公的儿子哈维尔王子领养了18名成年子女，每位收取10万欧元，让那些人得以顶着皇族的身份进出上流社会。盖瑞就是经办这些领养手续的律师，夏洛克把解决此事的权力交给了乔恩。
第二天，卡尔被传唤到警局，警监葛雷森先就此前的调查道歉，毕竟利兰的死与他并没有关系。随后，卡尔被带到审讯室外。室内，联邦探员科纳正在审讯杀手塔德。昨晚，就在乔恩和大公讨论之时，马库斯和科纳在夏洛克授意下，在暗网散布消息，称卡尔有意与警方达成认罪协议，以换取豁免权。真正的杀手塔德果然上当，他与利兰一样，也有保留资料的习惯。他赶到警局自首，将卡尔雇佣他杀害彼得的证据全部交给了警方。卡尔被正式逮捕，因涉嫌刑事犯罪被董事会开除，药价随即恢复正常。
乔恩来到盖瑞律师所，带给他一份波西米亚国王的亲笔信。信中，国王要与哈维尔王子断绝关系并撤销18个造假头衔。为免受欺诈指控，盖瑞只得向领养机构承认是自己工作失误，才导致乔恩没有参加亲子活动。乔恩换了个新代理律师，申请被再次受理，生活又走上了正轨。
第14集剧情介绍：生化袭击
乔恩闲着无聊，正给夏洛克养的小乌龟锉指甲时，继父亨利打来了电话。患有轻度阿尔兹海默症的母亲一大早一声不吭的驾车离开了，乔恩大吃一惊，赶忙向警方求助，发布全境协查通报。刚打完电话，她意外的发现母亲就站在自家门前。母亲的症状越来越严重，忘记告诉丈夫出门的事，连最喜欢的饭店已在三年前关门的事都忘得干干净净。
虚惊一场的乔恩打电话给警监葛雷森，想请他帮忙撤销协查通报。哪知警局已戒严，出了大事。原来今天上午，刚刚破获一桩谋杀案的马库斯从审讯室出来，想到走廊贩卖机买杯饮料放松一下时，发现走廊长椅上有个无人认领的旅行包。待要开包查看，包里突然冒出一股白烟直喷面门。马库斯赶紧屏住呼吸，拎起旅行包丢进最近的审讯室里，再脱下衣服堵住门缝。随后他一边让其他警员撤离，一边把自己锁在审讯室隔壁的观察室中。隔着单向玻璃，他看到哧哧冒出白烟的旅行包里露出贴有生化标记的毒气罐，不知道自己会有什么样可怕的症状出现。
葛雷森紧急动员，封锁全警局，并对外申请战略响应小组支援，同时联系疾控中心。从马库斯发现旅行包的过程分析，进审讯室之前还没有看到旅行包，仅隔了几分钟包就出现，而且还是在马库斯查看时毒气罐才被包里的手机触发。有理由相信，马库斯意外发现旅行包打乱了对方的计划，不得不提前触发，所以嫌疑人一定还在警局内。
乔恩打来电话时，疾控中心人员已赶到现场，隔离了整幢大楼。夏洛克从网上查到2012年，墨西哥一家警局有过类似案件。莱昂贩毒集团使用雾化炭疽袭击警局，造成大量人员伤亡。去年葛雷森就捣毁过他们的一间仓库，查封大批货品，逮捕多名中层管理人员。如今同样的手段再次出现，不能不让人怀疑到莱昂集团。
要明确检测出气体成分需要几小时或几天的时间，为了能及时对症治疗，夏洛克和乔恩决定去趟莱昂贩毒集团。葛雷森不希望二人涉险，但还是没能阻止二人的行动。夏洛克很了解莱昂集团，幕后老板叫费利佩，其侄子哈利在纽约开了间酒吧，用于毒品中转。进酒吧前，夏洛克把门口停放的奔驰车偷走，那可是费利佩送给哈利的礼物。
哈利无奈，只得请来了叔叔。夏洛克和乔恩长话短说，请费利佩说明毒气成分。见费利佩无意帮忙，夏洛克开出条件，愿把斯特帕诺夫黑手党拱手送上。莱昂集团与这个俄罗斯黑手党组织在皇后区争夺地盘多年，夏洛克能提供他们的货源渠道及所有情报。条件很诱人，但费利佩只知道以前制造用于袭击墨西哥警局毒气装置的费德里科已经死亡，其他的一概不知。
线索中断，夏洛克把这个不幸的消息通知了葛雷森。此时，马库斯已接受清理走出了观察室。疾控中心优先清理了旅行包里的手机，从中提取到一些照片，都是警局内部的布置。照片时间显示是1月1日12时，而调查下来手机服务的激活时间是在今天。看来嫌犯来警局踩过点，还有意清零时间设置，逃避警方调查。
已有两人出现了痉挛症状，葛雷森还是没能查出明确的线索。既然可以确定嫌疑人没有离开警局，他和马库斯打算讯问每个人，调查他们来警局的原因，是否对警察不满。可一番盘问下来，还是没找到线索。
马库斯拎过旅行包，里面的罐体加上手机是如何通过入口的金属探测门，让他百思不得其解。他突然想起上个月警局修缮过屋顶，建筑工人来来往往，说不定有人趁机将旅行包藏在屋顶，同伙再取出作案。马库斯进行交叉对比，发现有名建筑工人和刚才接受过盘问的女按摩师都在社交媒体上分享过同一场演唱会的照片。但这种联系太过牵强，葛雷森不能接受。
疾控中心对旅行包里的物体清理过后，倒是有了新发现。毒气罐与引爆器连接的方式与其他部分不同，使用的是环氧树脂，而且没有完全干透。这说明装置是由两部分组成，在引爆前才被组合到一起。
既然是分批带进警局，那嫌疑范围就扩大到了每一个人。就在葛雷森和马库斯懊恼时，夏洛克又打来了电话。他在葛雷森发来的照片里找到一条线索，照片里的时钟显示拍摄时间是下午6点58分。然后按照片搭出同比例模型，从光线透过窗户留下的阴影，结合天文数据，推导出拍摄日期是7月2日。
听到这个时间马库斯一愣，当天有小组会议，在那时段整个楼层被封了三个小时，只有分局的人在场。这下嫌疑人的范围转移到了警察的身上，夏洛克和乔恩登陆分局服务器，调阅每个警察的个人档案，认为警官肖恩嫌疑最大。他在调入葛雷森管辖的11分局前，曾两次因行为不当受处分，还因升职与直属长官发生过争执推搡。
虽然肖恩在接受问讯时矢口否认，但夏洛克查到他六年前收到过纽约警局颁发的十字勋章，原由是他外出执勤时遭遇枪击，英勇的击毙枪手。诡异的是，事发在斯塔顿岛，而当时肖恩被分派的却是四十公里外的布朗克斯区。乔恩再想登陆查看详情，却显示服务器无响应。
接到夏洛克的电话后，葛雷森才发现机房里的服务器被拆除。有人看到穿着防护服的疾控人员将整车服务器搬下了楼，大家都以为是例行的清理工作，所以也没人疑心。服务器里存储着所有部门的数据副本，包含案件资料、卧底名单、线人身份以及贩毒集团信息。这些数据，只要找到买家，就价值数千万。葛雷森只觉得脑袋嗡嗡作响，分明不是恐怖袭击，而是有预谋的抢劫案。
嫌疑人穿防护服，有疾控中心工作证，还熟悉生化袭击的应对流程，葛雷森把怀疑的目光投向了疾控中心工作人员。如果嫌疑人的目的是为了偷窥资料，那烟雾只能是制造混乱的手段，不可能有杀伤力。那两名出现炭疽症状的人，又是怎么回事。
就在葛雷森和马库斯感到困惑时，夏洛克和乔恩不穿防护服，径直闯进了11分局。肖恩和出现不适症状的丹尼尔斯、王被请进审讯室，夏洛克当面揭穿了他们的骗局。肖恩、丹尼尔斯和王的财务状况都是入不敷出，也正是因此，他们的资产被同一家公司收购，公司负责人米兰就是整个事件的策划人。两个月前肖恩拍照泄露警局内部构造，今天王和丹尼尔斯分别把部件藏在笔记本和假肢里带进警局，在卫生间组装，然后适当的时候假装中毒症状。另一名欠了赌债的疾控中心员工趁所有人忙于隔离时，搬走了服务器。这些人计划事后逃往国外，信用卡上的购票信息已经出卖了他们。
肖恩还想抵赖，可警方已逮捕了米兰，并在其车库里搜查到失窃的服务器。此时米兰已向地检供述了所有行动方案和同伙以换取减刑，肖恩彻底无话可说。
第15集剧情介绍：离奇无头案
巡警在处理一桩母鸡丢失的民事纠纷时，意外发现了一桩谋杀案。死者叫罗哈斯，是社区大学宗教学教授。死者头颅被砍，不知下落。尸身上还插着母鸡的头，周围除了母鸡的尸体外，还有一些融化的蜡烛，不排除是某种宗教仪式。法医正在检查鸡的尸体，希望它在反抗时爪子上能留下凶手的DNA。
夏洛克从不相信邪教杀人的说法，以他的经验，案件里的宗教元素都是干扰警方调查的手段。正在讨论时，警监打来电话，有人提供线索，很坚决的指出这就是一桩涉及神秘宗教的谋杀案。来人是市议会的参议员莱德斯马，与死者罗哈斯教授是好友。他说出罗哈斯除了是宗教学教授外，在神秘学也颇有造诣，曾帮警方破获过很多涉及到神秘元素的案件。莱德斯马与罗哈斯结识是缘于两年前发生在议员选区的离奇盗墓案，犯人从墓区盗走了多个头骨。罗哈斯认出是一种巫术，协助警方在当地年青人塞里奥家的地下室找到了头骨，塞里奥也因此入狱。莱德斯马议员怀疑，是有塞里奥的追随者杀死了罗哈斯教授。
马库斯和乔恩来到监狱提审塞里奥，了解到塞里奥是因为没有朋友，所以才想利用这些奇怪的巫术吓唬那些欺负他的人。看来塞里奥不可能有追随者，夏洛克在社区大学也没找到有人对罗哈斯不满，大家都很爱戴这位教授。马库斯只能回局里，联系各地的神秘学专家，看看是否有人认识现场的仪式。
夏洛克和乔恩回到褐石屋，就在讨论案情时，有人砸碎了后门玻璃丢进来一只酒瓶，酒瓶上写着“去找维尔神父，他知道谁杀了罗哈斯教授”。根据这条匿名线索，夏洛克和乔恩在教堂里找到了维尔神父。神父的回答让二人有些意外，他并不知道凶手的线索，却知道丢酒瓶人的用意。
这只酒瓶是钱佩里科朗姆酒，该集团在危地马拉建厂，工作环境极差。工人们想维权，却遭到当地非法武装力量的殴打、恐吓。罗哈斯的侄子伊凡也在酒厂上班，曾想组织罢工，被武装人员从家中拖出去后就下落不明。罗哈斯与侄子的几名工友保持着联系，其中有个叫瓦伦蒂娜的女孩，聪明能干。她决心成立工会，罗哈斯和维尔就帮她联系上了一家美国组织，工会联合会。两周前，按原计划瓦伦蒂娜应当到纽约与该组织接触，可出了机场后便失踪。警察没找到瓦伦蒂娜，罗哈斯就自己寻找线索，可能是他离真相太近，才招来杀身之祸。
马库斯和乔恩找到工会组织的报案人，了解到当天工会员工已为瓦伦蒂娜安排好了行程，可瓦伦蒂娜并没有来总部，与酒店联系才知道也没有办理入住，所以经办人向警方报了失踪案。报案人相信钱佩里科集团是幕后黑手，因为这不是他们第一次这么做了。
去年，纽约民间组织联合起来推动市参议会投票表决增加酒类营业税法案，最后被否决。几个月前，那些支持增税的人们陆续接到了上百个恐吓电话。还有人发觉自己被跟踪，警方根据其提供的车牌追查到车辆属于钱佩里科集团，但集团发言人声称车辆被盗，不了了之。
听了工会联合会工作人员的陈述，乔恩更加确定杀害罗哈斯的凶手就是钱佩里科集团。打电话给夏洛克，却又得到了相反的看法。因为夏洛克已见过钱佩里科集团总裁，他们的确从瓦伦蒂娜抵达肯尼迪机场后就开始监视，可瓦伦蒂娜出机场就躲进了一个社区的屋子里，与其他五名非法移民住在一起，并没有其他举动。既然瓦伦蒂娜赴美的目的只是为了能留在美国，钱佩里科集团也没必要去找她的麻烦。
瓦伦蒂娜还好好的活着，那罗哈斯就不可能是为了寻找她而被害。夏洛克和乔恩按照钱佩里科集团提供的地址找到瓦伦蒂娜，一进门夏洛克就看到留言板上的字条，上面的笔迹与酒瓶上的字相似。瓦伦蒂娜承认自己是为了肚子里的孩子放弃了维权大业，只想着永远离开危地马拉。三天前，罗哈斯找到了她，也体谅她的苦衷。临离开前，瓦伦蒂娜出于内疚给了罗哈斯一些照片。照片是工人们收集到的非法武装人员图像和私人侦探调查的钱佩里科私人安保图像，基本可以确定是同一伙人。也就是拿到照片的第二天，罗哈斯被害。瓦伦蒂娜看到新闻后，才想到给夏洛克提供线索，找出杀害罗哈斯的凶手。
夏洛克从瓦伦蒂娜的电脑里复制照片，回到家后反复查看。照片像素不高，能把非法武装和私人安保联系起来的只有手臂上相同的纹身，这并不会对钱佩里集团构成什么威胁。百思不得其解之际，马库斯打来电话，罗哈斯的头颅找到了。
夏洛克立即赶到现场。此时已是深夜，警监葛雷森出于礼节通知了莱德斯马议员。也许是出门匆忙，议员没带假发，露出了头顶的斑秃。这让夏洛克确认，莱德斯马议员就是杀害罗哈斯教授的凶手。
第二天，莱德斯马议员被传唤到警局。夏洛克拿出照片，其中有几张拍摄到钱佩里科私人保镖的雇主与人交谈的场景。照片显示，集团总裁将一个手提箱交给了另一个人，而那人的头顶上正有一块斑秃，位置恰与议员的一致。乔恩还查到，议员与夫人去年到危地马拉旅游，日期与拍摄日期相符。而那段时间，正是议会筹备表决加征酒类营业税法案之前，莱德斯马就是最积极的公开反对者。
莱德斯马议员还想狡辩，夏洛克无法证明手提箱里是钞票。可夏洛克并不是为了证明他的贪污罪，而是要拿到谋杀案的证据。法医已从鸡爪上提取到了血样，法院也根据照片发出了提取DNA的强制令，只要二者匹配，莱德斯马议员就逃脱不了法律的制裁。
第16集剧情介绍：完美目击证人
马库斯坐在办公桌前纠结该如何分配读研与工作之间的时间，手机上收到了夏洛克发来的消息，请他和乔恩务必到皇后区调查一桩谋杀案。赶到现场后，了解到死者为布鲁斯，死于胸口枪击，现场没有强行闯出的痕迹，值钱物品也没有缺失。这只是一起普通的案件，马库斯和乔恩不明白夏洛克为什么会对它感兴趣。
夏洛克感兴趣的不是死者，而是摆放在沙发上价值上万美元的性爱玩偶。看到马库斯和乔恩狐疑的眼神，夏洛克详细介绍了这具玩偶的奇特之处。玩偶是“完美伴侣10号”，具备语言功能，可模拟出多种恋爱感觉，连上网络还能交流用户喜好的事物。而且“完美伴侣10号”可以倾听，也就是说能记录现场的声响，说不定可以提供谋杀案的线索。
警方尝试进入玩偶的芯片，却发现使用的是加密内存。调查布鲁斯的银行账户后，夏洛克和乔恩才知道布鲁斯就是“完美伴侣”公司的员工。来到完美伴侣公司，从公司负责人处了解到布鲁斯负责面部设计并进行3D打印。由于警方无法破解芯片，负责人专程到警局激活玩偶，看看这位目击证人能否提供线索。
现场测试下来，玩偶无法准确理解马库斯的问话，只能让负责人提取出芯片中庞大的数据资料，以供警方调查。在问话过程中，夏洛克注意到另一件事。“完美伴侣10号”的面部与其他玩偶不一样，没有理想化，也不是那么对称。夏洛克认为布鲁斯很可能使用了真人的相貌，这明显违反公司的规定，也可能招来被模仿人的疯狂报复。
夏洛克和乔恩在布鲁斯的社交账户上找到了布鲁斯的前女友照片，相貌与“完美伴侣10号”一般无二。邻居也指认照片中的人在两天前曾出现过，而且与布鲁斯有争吵。夏洛克和乔恩在与布鲁斯前女友正面接触后，发觉她是个很理性的女人。杀了布鲁斯并不能召回已生产的“完美伴侣10号”，只有法律诉讼才可以。布鲁斯被杀的时间段里，她就是在律师事务所讨论有关“完美伴侣10号”的禁止令，没有杀人的时间。不过，她提供了另一条线索，在布鲁斯家的桌上，她看到普廖拉酒店的确认回执，可能是与某人有约，时间恰在布鲁斯被害的当天。
夏洛克和乔恩来到酒店。酒店工作人员正在撤除活动海报，从他们口中得知布鲁斯曾在一场演讲会上，与演讲人伊凡发生冲突。伊凡也记得布鲁斯这个人，只是不知道他叫什么名字。当时伊凡正在讲述政府的绝密项目，布鲁斯就突然从人群中跳了出来，大声喝问他是怎么知道这些计划，还喊着不应当有人看到计划，诸如此类的话。等伊凡叫来保安，布鲁斯抢走讲台上的一堆文件逃之夭夭。
伊凡从电脑里调出一些图纸，展示在夏洛克和乔恩面前。这个绝密项目是一种新技术，通过扫描有机材料，再利用电子传输，然后在另一个地方3D打印出来，以实现瞬间移动的功能。科技是把双刃剑，这项计划能造福人类，比如快速传递疫苗、血清，救人性命。但如果被恐怖份子掌握，就能随时随地发动生化袭击。这也难怪国家会将其列入机密，禁止外泄。
夏洛克还有个问题，伊凡是如何拿到这么重要的机密文件。伊凡的回答让人大吃一惊，就是一封匿名邮件，然后花一千美元拿到了项目资料。相对于这个项目，一千美元根本微不足道，夏洛克一时还无法推断发信人的目的。伊凡倒是相信，布鲁斯是因为抢走了那些资料才送了性命。
项目听起来像天方夜谭，可其中涉及到3D打印技术，的确属于布鲁斯的专业领域。或许布鲁斯是该项目的创始人之一，抢走文件是为了查找泄密源头，结果导致被杀。抱着这种想法，乔联系了布鲁斯攻读研究生时的加里森大学，想了解其在就读期间的研究项目。校方反馈的信息只确认他原本在生物信息实验室工作，导师为深田博士，目前已离校。对布鲁斯从事的研究项目，没有任何文字记录。
兵分两路，夏洛克去拜访深田博士，乔恩和马库斯则来到加里森大学。曾与布鲁斯共事的三名研究生仍在实验室工作，他们对布鲁斯的研究项目讳莫如深，都已跟政府签署了保密协议。当看到乔恩手里的项目资料后，他们也觉得很不可思议，项目资料应当都保管在学校的储藏室里。三人之中的格温觉得既然项目已经外泄，保密协议也就自动失效。她领着乔恩和马库斯来到教学楼地下储藏室，这才发现门锁被撬，所有的项目资料不翼而飞。
马库斯联系夏洛克，通告学校的情况时，夏洛克告诉他一个更可怕的事情。深田博士已经失踪，从屋外的车印和屋内的鞋印，夏洛克断定深田博士被军方劫持，看来伊凡的阴谋论并非空穴来风。
按照1951年颁布的《发明保密法案》，政府有权力控制可能危及国家安全的发明人，并禁止发明专利公开。警监葛雷森与军方高层沟通后，允许警方人员会见深田博士。夏洛克已追踪发信邮箱，确认是深田博士泄露了项目资料。这么做的目的应当是想让保密协议失效，从而通过该项专利赚钱。可能布鲁斯抢走资料后，也发现了这个秘密，才被深田博士所杀。在军方的会见室里，深田极力否认自己与泄密和谋杀有关。他还没蠢到会用自己的邮箱发送机密文件，这根本就是被人陷害。但深田博士也承认，在向国家提交专利时没有提及包括布鲁斯在内四名研究生的贡献。从某种程度上来说，是窃取了他们的研究成果。几个月来，他不断接到四人发来的恐吓邮件和威胁语音。
深田博士的邮件里确有不少研究生发送的咒骂邮件，因为保密法案，研究生无法申诉自己的研究成果被窃取，才会导致他们这么愤怒。如今资料外泄，保密协议解除，深田博士也会因泄露机密失去专利权，他们就能获取相应的功劳，这就有了陷害深田博士的动机。那嫌犯可能就在三名研究生当中，布鲁斯发现了泄密者才会被杀。
马库斯着手调查三名研究生，没有发现犯罪纪录和财务异常，暂时找不到线索。在调阅玩偶记忆芯片数据时，乔恩注意到布鲁斯偏好重金属音乐，芯片的歌单里却有首欢快的《我的铃声》，音乐风格与其他音乐格格不入，而且播放时间正是在布鲁斯被害的时间段内。这一次，乔恩在夏洛克之前找到了凶手。
第二天，三名研究生被传唤到警局，与“完美伴侣10号”对质。三人按马库斯的要求拿出手机，夏洛克逐一拨打。拨打格温的手机时，屋里响起了节奏明快的“我的铃声”。格温盗窃资料，陷害深田，谋杀布鲁斯，没想到机关算尽，却被“完美伴侣10号”录下了她的铃声。目击证人“完美伴侣10号”，终于完成了自己的任务。
第17集剧情介绍：蠕虫
夏洛克接到主治医生助理的电话，通知他到诊所来一趟。开始，他以为是病情没有好转。可出乎意料的是，富林医生诊断他已从脑震荡后遗症中康复。此次请他来，是因为诊所被盗，有人偷走了电脑、检测设备，还有包括夏洛克在内的一批医疗档案。自己的信息有被泄露的可能，夏洛克决定找到那名小偷。
另外，在米勒顿大学的线虫学研究实验室里发现了一具干尸，是该校无脊椎动物学高级教授威廉博士，在业内被称为“蠕虫猎人”。死者被一字螺丝刀刺破颈动脉，肢解后丢进肥料箱，与他一生致力研究的蠕虫混在了一起。凶手还拿走了死者的手机和办公室电脑硬盘。
威廉教授拥有一副健美的身材，很受女性欢迎。他失踪三周却没人报警失踪，这让马库斯有些想不通。查了学校的工作安排才知道，他应当前往亚马逊考察，所以才没人发现异常。从实验室门口的监控来看，三周前教授是活着出了实验室。可夏洛克注意到监控里教授穿的衣服与尸体的衣服不一致。调阅几个月的监控，都发现类似情况。安保主管只能承认教授经常与学校里的各种女性在实验室幽会，每次都会让主管关闭监控，事后再用其他日期的录像填补。为了证实自己的说法，主管拿出手机，里面有一年之内威廉发来的短信。最后一条的时间，就是在他被害当晚。
夏洛克查看威廉教授办公室里的命名板，上面都是教授发现并命名的蠕虫。这些名字都有个规律，是以拉丁文注明的人名。以这条线索找到了教授的情人之一爱莉丝助教，把命名板上的名字都翻译过来，与学校名单进行交叉对比，还真找到了不少。
其中赛比与众不同，也是学校的生物学教授。她把人看成是满足欲望的动物，对威廉拈花惹草并不在意。她认为另一名学生贝卡很可疑，在课堂上争辩，抱怨分数，还撞过她的车，就像只嫉妒的母狮。
监控录像的确显示贝卡的车在案发当晚七点半进入学校停车场，两小时后才离开。可她当时在家，车被丈夫开走到。贝卡的丈夫唐尼被传唤到警局后承认，是他杀了威廉，对胸口连开三枪，枪被丢进了下水道。这与法医鉴定不符，在夏洛克的要求下，重新进行尸检。这一次，法医在肋骨上发现了三处细微的骨折。
这种现象，说明死者穿了防弹衣，可现场并没有找到。根据唐尼交待，威廉当时穿了一件新奇的银色运动衫，但死者身上并没有这件衣服。如果情况属实，那就是世上最薄的防弹布料。教授可能就是为这个价值数百万的科技创新，送了性命。
乔恩查了威廉的银行流水，用度明显比收入高得多。或许是通过榨取科研经费维持高档酒店消费，导致某人不满。教授最大的赞助人是霍伊特护甲公司，出资二十万用于一项没有详细说明的研究课题，很可能就是以虫类分泌物制成防弹纤维。
霍伊特护甲公司总经理强恩还被威廉的邻居看到与威廉发生过争吵，夏洛克怀疑是因为教授私自用研发出的防弹材料制成防弹衣，并出售给了其他人。强恩承认有过争吵，出二十万是为了找一种能大量合成生物有机纤维的蠕虫。威廉一拖再拖，就在争吵发生后，教授就提供了样品，现在公司的科研部门仍在进行研究。说起威廉要穿防弹服，他想起一件事，威廉收到过匿名威胁邮件。
威胁威廉教授的邮件是一个月前发送的，夏洛克找黑客朋友梅森查出邮件来源，是来自于一家投资公司的业务员奎恩。奎恩承认她发过很多类似邮件，都是蠕虫病毒，用于入侵电脑。她的目的是下载威廉教授电脑里的资料，以判断霍伊特护甲公司是否有新研发的项目，是否值得投资。但事实证明，不值得。
夏洛克和乔恩连夜翻看了奎恩提供的威廉电脑里的资料，里面都是蠕虫的研究数据，唯独没有他身上穿的那件防弹运动衫。如果运动衫不是威廉自己制作的，那可能就是收到威胁邮件后太过当真，从别人那偷来防弹运动衫防身，之后又被人夺回，还送了性命。
夏洛克以投资为名，找了几家生物防弹材料研究室。对他们提供的样品，一一进行枪击测试，找到枪伤痕迹最相似的奥贝莱特实验室。负责人听后苦笑，提供给夏洛克的一小块样品还是收集了六个月的蜘蛛丝才制成。在没有找到量产方法前，根本制成不了运动衫那么大的防弹衣。
不过实验室几个月前发生过实验蜘蛛被盗事件，最大的嫌疑人就是进入过培养室的米勒顿大学生物学教授赛比。再深查下去，赛比正在投标联调局的防弹衣合同，提供的样品与教授死亡当天穿着的运动衫一模一样。哪知赛比的回答出人意料，那件防弹衣就是她借给威廉的。她已经掌握了量产技术，无需再遮掩。
为了证明自己的说法，赛比拿出一些照片。她把蜘蛛的基因注入蚕的体内，能大量生产出防弹纤维。不过夏洛克看出，蚕架空了一半，饲养用桑叶枯黄，这应当才是杀人动机。但在逮捕赛比前，还需要找到证据。
从联调局反馈来消息，现在的防弹衣供应商是霍伊特护甲公司。要想继续取得合同，就必须破坏赛比的蚕丝生产。赛比的蚕需要食用特殊桑叶，蚕场里种满了这种桑树。可照片里，桑树几近凋零。专家辨认出是死于线虫侵袭。从奎恩提供的资料里，威廉在去年花费很大精力培养了一种抗杀虫剂的线虫，资助人正是强恩。
强恩也承认了这一点，可他的小动作并没有成功。威廉被害的五天后，赛比不知用什么方法救活了桑树，又成为最有希望的投标人。夏洛克却知道原因，因为在威廉的资料里也有杀死该种线虫的方法。赛比同时喷洒了两种不同杀虫剂，有效遏制了线虫蔓延。这个配方非常机密，连强恩都不知道。赛比得到配方的途径只有一个，从威廉的硬盘里。警方向法院申请搜查令，在赛比家中找到了教授的硬盘。
夏洛克也找到了洗劫诊所的人，不过是个吸毒成瘾的家伙。有人指示他这么做，还指定要有夏洛克的档案。夏洛克能想到的只有一人，迈克又回来了。在夏洛克从脑震荡后遗症中恢复后，又要挑起一场战争。
第18集剧情介绍：讣告预言
夏洛克在褐石屋里遥控乔恩破获一桩乐器被盗案时，传来了敲门声。来人叫大卫，如果不是因为性命攸关，夏洛克还真懒得让他进门。随后大卫说的话，让夏洛克兴趣高涨，把乐器的事丢到了一边。
几个月前，大卫的哥哥诺曼去世。医生认为是吸毒过量，但大卫觉得是患有精神分裂的诺曼长期混用大量处方药才导致体内含有巴比妥酸盐。在诺曼去世的一年前，大卫帮他找了份工作，给当地小报社写讣告。诺曼非常喜欢这个工作，以至于给一百多个还没死的人写了讣告。这些人都是普通人，诺曼生前也不认识。讣告里写明了他们去世的时间以及方式，由于太过无稽，全部被报社退了回来。大卫没当回事，把这些讣告收到了哥哥的抽屉里。可自从诺曼死后，已经有三起讣告成为现实。去世的时间和方式，与诺曼所写的讣告一般无二。夏洛克听后大喜，很久没碰到这么离奇的案子了。但大卫此来并非雇佣，而是来警告他。如果讣告预言准确，那夏洛克就是下一名死者，三天后被人枪杀。
乔恩独自找出被盗乐器，然后按照夏洛克发来的地址，抵达大卫家。夏洛克是来了解更多有关诺曼的生活细节。根据大卫所说，诺曼从小就很有才华，上学期间写过科幻小说，很受出版商重视。也是自那以后，他就出现了幻听，精神状态每况愈下。大卫的妻子卢出于好意收留他，把地下室改造成小公寓。而疾病并没有束缚诺曼的手脚，经常外出参加社交活动。
诺曼居住的地下室里堆满了市面上所有的科技书籍，这是他的爱好之一。他用模拟论解释自己的疾病，认为上帝就是个程序员，世间一切都是被编排好的，用0和1模拟出来的虚幻。大部分人只是这个游戏中的NPC，只有小部分人才是主角，就比如他自己和历史上那些伟人。他们的共同点是能看到未来的闪现，诺曼也是从闪现中看到一些人的死亡，提前写下了讣告。
夏洛克觉得这种想法很危险，如果诺曼有追随者，可能就会用杀人的方法证明模拟论的正确性。卢记得诺曼时常去模拟论研讨会，的确吸引了一些听众。乔恩从桌上找到份通信纪录，是诺曼与模拟论的粉丝在进行交流。这个粉丝的名字看起来很眼熟，是机械地狱犬一案中的亨利·巴斯克维尔先生。
亨利是几家上市科技公司的总裁，在地狱犬一案中得到夏洛克和乔恩的帮助躲过一劫。见救命恩人拜访，他是知无不言，言无不尽。实际上他与诺曼算不上熟识，只是在模拟论上有过些交流。亨利还提供了份名单，里面都是参加研讨会的积极份子，也许诺曼的同谋就在其中。
乔恩提出了自己的计划。夏洛克留在褐石屋分析这份名单，她则与马库斯去调查三起死亡事件。只要能解决其中一起，就能破解所有疑点。克里斯蒂娜自杀案昨天才发生，就成了乔恩和马库斯的首要调查对象。走访克里斯蒂娜的丈夫后，二人才知道克里斯蒂娜没有留下遗言。死者跳楼自杀时，丈夫在外地出差，不可能是因为发生争吵而情绪激动所致。二人来到公寓楼顶，露台上满是取暖通风管道飘落的煤灰。从杂乱的鞋印中，乔恩找到克里斯蒂娜所穿的坡跟鞋印，一直延伸到护栏。环视四周，乔恩发现附近有幢新建公寓楼，可能会在天台安装监控摄像头。
可让夏洛克、乔恩和马库斯很失望，监控显示克里斯蒂娜确实是自己翻越护栏，跳楼坠亡，身边并无其他人。另两起死亡事件，一个是骨癌患者，一个是车祸，都没找到有用的线索。夏洛克通宵反复观看克里斯蒂娜跳楼的监控录像，如果不找出其中的原因，那明天诺曼的预言就会在他的身上实现。
天刚蒙蒙亮，夏洛克就接到大卫的电话。他家门口有六辆新闻车，现在所有人都知道讣告预言的事了，模拟论一下成为全国热点。第10频道女记者格西瑞据称从线人那得到了诺曼的所有讣告电子档，可供人们查询自己是否在列。这种行为相当于在无形中赞扬一名凶手，夏洛克觉得厌恶的同时，又有一份欣喜。能把讣告内容交给记者的人，可能就是诺曼的同伙。
夏洛克冒充BBC执行人找到记者格西瑞，想打听线人的身份。但格西瑞没有上当，夏洛克只能开出另一个条件，可以让她独家报道整个事件背后的连环杀手。
格西瑞提供的线索又是条死路，消息来源于匿名电话。是一次性电话，声音也经过变造。线人只告诉格西瑞讣告文档在网上的位置，藏在“真亦假网”的一个私人聊天室里。这聊天室只有四十多名匿名成员，都是模拟论信徒。几天前有个新成员加入，网名“觉醒宝贝”。他们发布的唯一公告就是上传了诺曼的讣告预言，起初无人理会，直到媒体放出新闻才引起关注。
在马库斯调查版主“迪兹司令”时，乔恩也横向对比了其他网站使用相同网名的情况，发现有上百个“觉醒宝贝”在疯狂发帖，使用相同的一套语法和修辞，明显是同一个人。晚上，亨利赶了过来。几小时前有人变造声音打电话给他，让他看第10频道的报导。夏洛克看了一眼电话号码，与打给格西瑞的电话一致。似乎此人觉得事情闹得不够大，还要更多的人散播消息。
这时马库斯发来消息，已找到了“迪兹司令”，是名叫泰瑞的男子。亨利知道这个名字，就在他的名单上。夏洛克同样也知道这个名字，诺曼的讣告中也有这人，三周后将被绑架折磨致死。
马库斯带人敲响泰瑞家门时，听到屋里有椅子翻倒的声音。他立刻撞开门，正看到想悬梁自尽的泰瑞。看过讣告的泰瑞已经吓傻了，宁可上吊也不愿遭受三周后的折磨。被警察救下后，他反而更加确信诺曼的预言不虚。但自杀行为不能打消夏洛克对他怀疑，他可能是惧怕诺曼预言成真，也可能是听到警察敲门畏罪自杀。
泰瑞自认是和平主义者，排斥任何暴力。至于在聊天室里注册的人，都使用VPN隐藏了真实IP。不过泰瑞坚信他们不会做杀人的事，他想起诺曼另外还有个朋友。诺曼在撰写一部有关预言的书，上面记载了他所看到的未来事件，被称为“天启”。这本书是用白墨水写在黑纸上，那位朋友帮他润色。在完全准备好之前，诺曼和他的朋友不会让任何人看那部写满预言的杰作。现在发生了这些事，可能说明他们已完全准备好了。
夏洛克先回褐石屋接受警方保护，乔恩和马库斯来到大卫家。大卫和卢在地下室里翻箱倒柜寻找那本书，乔恩无意中在垃圾桶里发现了被碎成细条的黑纸。再过三小时，夏洛克就要躺在停尸间了。乔恩把细纸条全部拿回褐石屋，花费了一个小时的时间才拼出第一章的第一页。但很奇怪，这一页上写的几条预言都没能成为现实。
乔恩刚觉得松了口气，马库斯就打来电话。有人拉响了中央车站警报引发慌乱，乘客都纷纷逃离车站。拉响警报的不是别人，正是亨利的安保主管格雷戈。夏洛克和乔恩找到亨利时，亨利承让是他让格雷戈拉响警报。这么做是为了阻止一场恐怖袭击，否则会有疯子用机枪扫射人群。
说完，亨利从抽屉里拿出一本黑底白字的书，是诺曼的奇书“天启”。这是他今天花四百万美元从一个人手里买下来的，夏洛克不用猜就知道一定是大卫。整件事都是大卫和卢的阴谋，搞出这么多事不是要迷惑大众，只是为了迷惑亨利。把一本分文不值的书，卖出了大价钱。在三起谋杀案和两个愚蠢侦探的帮助下，他们终于达到了目的。
警监葛雷森派战术小队前往大卫家，早已人去楼空。马库斯在收集残留物证时，一张照片引起夏洛克的注意。大卫和诺曼站在一棵伯拉切罗树前，这种能开出喇叭状花朵的树只生长在哥伦比亚和委内瑞拉一片很小的区域。因其种子能制成毒药“恶魔之息”，吹到脸上或者洒在饮料中，受害者就会失去自主意识听命于人，这也就是克里斯蒂娜跳楼的原因。
卢是哥伦比亚人，她的哥哥是进出口商。夏洛克断定大卫夫妻二人会偷渡哥伦比亚，马库斯紧急搜查停泊在港口的货轮，从船舱里抓到了大卫和卢。
第19集剧情介绍：洪灾地图
乔恩一大清早就被夏洛克叫醒。在说完昨晚破获的一桩水母毒素致死案后，夏洛克提到了另一件事，哈伦打算雇佣他们找个人。哈伦是应用数学方面的教授，帮过夏洛克不少忙。他要找的是博士生莉莉，本来约定今早来论文答辩，却迟迟未见到人。乔恩很奇怪哈伦为何如此着急，一个成年人失去联系两三个小时并不是什么大事。夏洛克却看得出哈伦喜欢那个博士生，但害怕牵扯出师生恋，所以才不敢报警，转而向私人侦探求助。
正说着，传来敲门声。门口站着两名联邦探员，奉命前来调查哈伦。1小时前，莉莉父母接到绑匪电话，索要50万美元赎金。因学校里对哈伦和莉莉之间的关系早有风言风语，所以哈伦就成了首要嫌疑人。夏洛克便决定留下来听听探员们都查到了什么，乔恩则到学校进行调查。
莉莉最后一次被人看到是前天晚上十一点离开学校图书馆。她的公寓离学校只有几个街区，乔恩在这段范围里排查，找到住在街边货车里的目击者。目击者称当晚看到一个男人把莉莉推进辆蓝色丰田车，以为是夫妻吵架就没上前阻止。目击者所说的男性体格与哈伦明显不符，但乔恩把这条情报告诉联邦探员后，并没有受到重视。
探员的调查重点都在哈伦的身上。夏洛克和乔恩收到马库斯发来的消息，用于绑架的车辆已被找到，停在一所废弃学校外面。联调局在学校里发现一具尸体，死者名叫吉姆斯，有持枪抢劫前科，体态特征符合目击者所说的男性人员。凶器是走廊上的灭火器，看来并非有预谋的杀人灭口。吉姆斯口袋里有部一次性手机，与打给莉莉父母的电话号码一致。门外的车辆又是失窃车辆，没什么可用线索。
进入隔壁的教室，椅子腿上发现胶带痕迹，地上还有莉莉的眼镜。夏洛克在垃圾桶里找到两瓶饮料罐和科学计算器包装，断定并非绑架。这种饮料是莉莉思考问题时习惯饮用的能量饮料，绑匪的目的不是为了赎金，是要解决某些算式。一旦完成，莉莉就必死无疑。
夏洛克推测，绑架的最初目的是为了某项复杂的数学问题。当吉姆斯得知莉莉家境富裕就打起了歪主意，想索要赎金。他与同伙发生争执后，被杀。也正是因此，反而排除了哈伦的嫌疑。毕竟哈伦的数学能力远高于莉莉，没必要实施绑架。
乔恩和马库斯拜访了吉姆斯的假释官。从资料上看，吉姆斯是个头脑简单的家伙。假释官最近一次见他是三天前在他的公寓里，一切都很正常。根据资料上房东的名片，夏洛克、乔恩和马库斯找到房东马文，进入吉姆斯家。屋里还算整洁，桌上摆满了博彩杂志。一张报纸上还留下了斑斑点点的印痕，那应当是“宾果”游戏留下的痕迹。这种需要大量数学运算的游戏，的确有用到数学家的可能性。
来到当地最大宾果游戏店，据称吉姆斯欠了老板娘西尔维亚一万元的赌债。或许吉姆斯就是帮她绑架莉莉，然后计算出一套中奖机率更低的排线方案。西尔维娅起初很不配合，直到夏洛克看出摇奖机里少了两个彩球。为了不被停业，西尔维娅只能承认认识吉姆斯，但对绑架一无所知。她根本不需要数学家，自有一套办法降低中奖率。而且吉姆斯已清偿赌债，有监控录像为证。监控录像证实了老板娘的说辞，吉姆斯用以偿还赌债的钱可能就是绑架的定金。
距离莉莉失踪已过去了72小时，仍没有任何进展。就在夏洛克一筹莫展时，哈伦打来电话，莉莉现在就在他家。来到警局后，莉莉说出了被绑架的情形，前半部分与夏洛克的推测差别不大。吉姆斯被杀后，莉莉戴着头套，困在后备箱里，到了一处地下室。完成计算工作后又被塞进后备箱，这一次她感觉到身边有个铲子，意识到生命有危险。她便用铲子边缘割断绳子，摘下头套。当车子停下来等候红绿灯时，就踹开后备箱逃了出来。她先赶来警告哈伦，哈伦有可能是下一名受害者。因为绑匪让她计算的东西，其实是哈伦的工作。
绑匪让莉莉修改的是一份应急管理洪水地图。地图把洪灾风险细化到每个区域，用以安排紧急预案，洪灾保险额度等。哈伦三年前参与过地图的绘制，通过大量数据计算确定洪灾发生的概率及影响范围。最近，这张地图进入公审阶段，还未正式公开。莉莉修改后的地图，在布鲁克林地区有偏移，部分抢手地段被包括在了高风险范围内。
当年哈伦只是参与地图绘制的专家之一，姓名没有列在名单内。莉莉在课堂上听说过此事，几周前到泛滥平原协调官办公室，调阅这份地图，还留下了身份证明复印件。可能绑匪就是在那注意到了莉莉，只要修改了地图，该地段的保险费就能翻上好几倍。
乔恩和马库斯找到了此地段的保险推销员亚当，但他并没有作案时间。夏洛克又把目光转移到被移出风险区的地带，那里是工业区保费本来也不高。不过，洪水风险不只影响保费，还影响着土地规划和开发标准。从市政局收到土地注册人名单，乔恩一眼就看到了绑匪的姓名，吉姆斯的房东马文。
根据国土局资料显示，有家高科技公司正准备从马文手中购买其名下的土地，用于建设总部大楼。但如果应急管理洪水地图被公开，他的巨额土地补偿金就会泡汤。马文因此事去过洪泛区办事处，与莉莉到协调官办公室正是同一天。被传唤到警局的马文还想狡辩，但警方已在他的地下室发现了几根长发和一块血迹，确认属于莉莉。
第20集剧情介绍：迈克回归
一名女性在夏洛克常去的互助会场被杀，手法与迈克几乎一般无二，同样是被橡皮管勒颈窒息而死。现场没有挣扎的痕迹，应当是移尸至此，很明显是故意要让夏洛克看到。死者名叫瑞秋，才28岁，是对冲基金公司的初级分析师。夏洛克闻到死者头发里有股淡淡的巴奎赛尔的气味，是一种用于泳池消毒的化学品，推断死者死前曾游过泳。
因迈克已涉嫌在三个州杀人，联调局派来金姆探员负责调查。目前联调局和纽约警局都没有迈克藏身处的线索，乔恩正在警局里调阅资料时，收到一份“人人”组织送来的大礼。因为“人人”也不喜欢迈克这类杀人犯，所以这次算是免费提供线索。银行数据显示，与迈克相熟的威廉昨天从银行取走了9900美元现金。威廉是唯一支持迈克的人，始终认为迈克蒙冤。而且低于一万美元的金额可以逃避国税局监控，不能不让人怀疑他就是为迈克提供资金的人。
乔恩和马库斯来到威廉家，得知那笔钱款是支付给女佣阿尔巴，用于治疗其在危地马拉的母亲。同时，夏洛克带着内疚的心情拜访了瑞秋的母亲，也没得到有价值的线索。此时乔恩接到葛雷森的电话，和夏洛克一起赶到警局。不可思议的事发生了，迈克就坐在警局的审讯室里。
一小时前，迈克出现在警局。联调局想抢先进行审问却无功而返，迈克只愿意和夏洛克交流。这一次迈克面露无辜，矢口否认与瑞秋被杀有关联。夏洛克没有理会，在桌上摆出所有受害者照片，极力想从迈克的话语中寻找破绽。迈克并未上当，除了瑞秋一案，其他的事情一概不提。既然话不对路，他也就不再多说话，起身离开了警局。
在警监办公室里，金姆探员认为夏洛克逼问太紧让迈克有所警惕。葛雷森则支持夏洛克的做法，迈克敢来警局必是有所计划，打乱他的步骤才是上上之选。想到迈克能来警局，一定是威廉与他取得过联系。马库斯和乔恩又来到威廉家附近，从邻居处打听是否有人见到过迈克或者死者瑞秋。
一名邻居反应见过迈克，还是几年前威廉丈夫雷过世的时候。威廉和雷都曾是瘾君子，二人在互助会结识了迈克。几个月后雷复吸，在痛苦之中给威廉发了封邮件，称不想拖累威廉，然后上吊自尽。想到迈克视威廉为至友，又惯常以橡皮管杀人，乔恩不由得怀疑是迈克勒杀雷再伪造自杀。邮件也可能是迈克逼迫雷或者杀人后冒雷之名所写，目的就是帮助至友摆脱戒毒干扰。
乔恩把自己的想法发给夏洛克，却迟迟没收到反馈。回到褐石屋，她才知道夏洛克关了手机正在调查另一条线索。就在马库斯和乔恩排查威廉的邻居时，夏洛克绕过联调局的监视人员与迈克在昏暗的停车场见面。迈克只说瑞秋是死于其他人之手，而且凶手对死者心含怨恨，这是他作为连环杀手的感觉。
夏洛克所注意的不是迈克的话，而是迈克车钥匙上的钥匙扣。那是枚5年戒毒纪念章，在迈克离开纽约之前夏洛克并没有见过，必定是最近几个月才有资格得到。回来后，夏洛克查过网络，只有一家“戒毒有你”的网站有售。“人人”入侵网站服务器，提取近几个月的发货地址。夏洛克分析出最有嫌疑的一个地址，是距离纽约市两百多公里的奥尔巴尼市，收件人叫理查德。把迈克的照片发送给理查德住所公寓管理员，确认系同一人。就在乔恩到家前，夏洛克匿名报警，称曾看到受害人瑞秋在理查德住所外遇到麻烦。
葛雷森警监凭着此条匿名线索向法官玛丽琳申请搜查令。玛丽琳一向以严格著称，多次因证据不足拒绝签发针对迈克的搜查令。此次仅是条无法查证的报警线索，她仍想拒绝葛雷森。葛雷森内心真的有些恼怒了，他让玛丽琳自己想想，迈克不在纽约的几个月未发生过类似案件，迈克一回来就出现一具尸体。在葛雷森坚持下，玛丽琳才签下对理查德公寓的搜查令，但迈克在纽约的住所不在搜查范围之内。
对理查德公寓进行突击搜查，果然查到一间暗室。暗室里有不下三十张女性照片，看来迈克正在寻找下一个目标。其中一张照片背景是个银行的大屏幕，上面显示当时的时间、日期和温度。日期和时间正是瑞秋被害的时间，证实案发时迈克在一百多公里外跟踪另一名女性。
纽约警局调取当时当地的监控，确认照片并非伪造。像迈克这种连环杀手不会有同伙，只有一种可能是模仿犯罪。杀人手法能模仿得如此神似，说明凶手有迈克案件的第一手资料。在夏洛克分析所有能接触迈克连环杀人案资料的警方人员名单时，乔恩再次来到威廉家。她出示了雷的尸检报告，脖颈处有一深一浅两道淤痕，从侧面印证了乔恩的想法。威廉一时无法接受，把乔恩请出了家门。
此时夏洛克在名单里没有发现任何人有明显的动机，也没找到有人与迈克或瑞秋产生过交集。葛雷森决定反向调查，与夏洛克到瑞秋工作的基金公司。夏洛克发现瑞秋办公桌的抽屉被人为损坏，要想找到拿走资料的人并不困难，整座大楼都有严密的监控。但已经不需要这么麻烦，葛雷森在翻阅瑞秋的客户名单时，一眼就看到了最可疑的人，公司合伙人丹尼尔。
丹尼尔是法官玛丽琳的丈夫，而玛丽琳很了解迈克的系列杀人案。在对丹尼尔进行询问时，他承认与瑞秋有婚外情，撬开瑞秋的抽屉就是为了取走里面的合照。丹尼尔家有个泳池，因为玛丽琳对氯过敏，一直使用巴奎赛尔消毒。在瑞秋被杀当晚，玛丽琳按惯例应当是去参加律师协会周会。瑞秋知道玛丽琳每周的这一晚都不在家，会用备用钥匙开门，然后边在泳池游泳边等待丹尼尔回来。可那晚，丹尼尔并没有见到瑞秋。
种种迹象表明是玛丽琳杀死了瑞秋并嫁祸迈克，迈克认为凶手痛恨死者的直觉没有错。这些间接证据明显不能扳倒一名法官，但出于职业道德玛丽琳与地检签署了认罪协议。褐石屋里，乔恩接到夏洛克的电话后，心中为破获一桩谋杀案而欣慰，却没有发现手中攥着橡皮管的迈克站在她的身后。
威廉经受不住刺激又复吸了，迈克把这个责任归咎到了乔恩身上。可乔恩也不是好惹的，在搏斗中捅伤了迈克。迈克落荒而逃，乔恩被送到医院。幸好只胆两根肋骨轻微骨折，几种水肿，并无生命之忧。赶到医院的夏洛克和葛雷森对联调局监视不利很愤怒，不过此事也有好处，可以立刻申请针对迈克的通辑令。
警方和联调局布下天罗地网缉拿迈克，可谁都没想到，当迈克被找到时已是被丢进垃圾堆的一具尸体，乔恩成为联调局的首要嫌疑人。
第21集剧情介绍：人面依旧
谁都想不到，几天前袭击乔恩的迈克，几天后会被人发现死在了垃圾堆里。乔恩是最大嫌疑人，除了乔恩无法提供有效的不在场证明外，金姆探员还在迈克打给威廉的电话录音里找到了“铁证”。录音里，迈克鼓励威廉戒毒，突然传来打击声，随后迈克喊了声“乔恩”就再没有了声息。夏洛克为乔恩请来纽约州最好的律师，但乔恩要面对的麻烦不只是电话录音，还有志在必得的金姆探员。
找回清白的最好办法就是抓到真正的凶手。夏洛克和乔恩已被禁止靠近警局，无法再利用警方资源。夏洛克想用点非法手段，私下拜访了葛雷森警监。但是他的违规要求被警监断然拒绝，于是夏洛克一不做二不休，偷偷潜入停尸间，复印了一份迈克的验尸报告。
褐石屋里，乔恩仔细阅读了验尸报告。迈克的死因是头部钝器创伤，符合乔恩平时防身所用的伸缩警棍特征。迈克右眼破裂，颧骨骨折，这种伤口会让双眼充血，说明其被害时处于半失明状态，很可能认错人。最让夏洛克和乔恩不解的是，迈克胸口被乔恩捅伤的伤口已缝合。验尸报告注明是在受伤后两小时内接受的处理，从缝合线特殊的黑色以及老式的缝合手法上，乔恩猜测替迈克处理伤口的人曾是名越战时期的军医。
夏洛克马上就想到了一个人，同为戒毒互助会成员的丹尼。丹尼反反复复戒毒十年，在讲述自己的故事时，没少提越战给他带来的心理创伤。丹尼还有一个癖好，收集越战时期的各种纪念品，其中自然少不了一两个医疗包。
夏洛克找到丹尼后，没说两句丹尼就承认几天前的晚上，迈克来到他家。当时迈克流了很多血，称是被毒贩捅伤。本着互助会的精神，丹尼帮他处理了伤口，还留他在沙发上休息一晚。第二天早上丹尼外出办了点事，回来后发现迈克不告而别。直到晚上看新闻，他才知道迈克被杀，还牵涉到多宗女子被害案。因为害怕受牵连，他才不敢向警方报案。
听了丹尼的话，夏洛克仔细查看丹尼的家，在墙壁上找到几滴不易察觉的喷溅血迹。他让乔恩送来发光氨喷壶，在地板上发现了更多痕迹。看来凶手是在这里杀害迈克，并清理了现场。从现场显现出的脚印看，凶手是名女性，鞋码与乔恩一致。
领先警方得到这些线索，并没有让二人高兴起来，反而更加担心。回到褐石屋后，夏洛克和乔恩思索着凶手是如何知道迈克的去处，最大的可能性就是凶手能接触到有关迈克的所有调查资料。资料目前都在联调局手中，再结合金姆探员极力把罪名扣到乔恩头上，不得不让夏洛克怀疑是金姆要为民除害又想栽赃给乔恩。夏洛克立刻发短信让丹尼烧毁现场，他还特意找了纵火犯，并出资几百万让丹尼另觅住所。他绝不能让金姆找到机会重返现场，把乔恩的罪名坐实。
就在联调局调查乔恩的时候，马库斯冒着风险送来了最新的调查资料。资料中有迈克尸体周边每块垃圾的照片，均为来自哈莱姆区。而迈克被杀的地点是几十公里外的皇后区，除非是有哈莱姆区的垃圾车开到皇后区。夏洛克想到了一个人，在环卫局工作了三十多年的垃圾车修理工柯蒂斯。
柯蒂斯的儿子格雷厄姆曾因杀妻入狱，是夏洛克证明了他无罪。迈克才是真正杀害柯蒂斯儿媳的人，所以柯蒂斯完全有理由痛恨那个让他儿子饱受折磨的家伙，也有意愿帮助凶手抛尸。在环卫局的停车场里，柯蒂斯对夏洛克的问话一脸不屑。他视杀死迈克的凶手为英雄，就算知道凶手的相貌也不会告诉任何人。也正是从他异常镇定的态度里，乔恩猜测夏洛克的判断有误，不是垃圾车去过皇后区，而是凶手把尸体送到这里，交给柯蒂斯抛尸。
环卫局停车场有24小时保安，当夏洛克索要监控录像时，保安的回答让他大吃一惊。两天前有人举报设备被盗，警方来人调查时把录像拷贝了一份，却在操作时无意中删除了所有原始录像。夏洛克几乎能断定这个人就是金姆探员，可又让他吃了一惊，保安记得来人叫葛雷森，是名警监。
晚上，葛雷森回到家，发现屋里一片凌乱，夏洛克就坐在黑暗之中。夏洛克没有找到所谓的“录像拷贝”，葛雷森颓然的坐到桌边。夏洛克已想到凶手就是汉娜，葛雷森出于护犊之心帮她抛尸灭迹。见夏洛克已知道了真相，葛雷森也不再隐瞒。自从室友麦迪被杀，汉娜就对迈克进行了深入调查，了解迈克生活中的每一个人。听说乔恩遇袭，凭着直觉她守在了丹尼的家门前，看着迈克进门。趁丹尼外出，她潜入屋内，用警棍将迈克活活打死。几小时后，葛雷森接到开酒吧的朋友电话，知道汉娜情绪激动。送汉娜回家时，汉娜向父亲说出了一切。
让乔恩卷入其中，葛雷森也很内疚。可他不愿向联调局交代实情，汉娜是名警察，不忍心看着她进监狱受折磨。他把希望都寄托在金姆探员找不到实证，案件就此成为悬案，对乔恩的指控也会不了了之。但夏洛克绝不能接受这样的结果，有了这个污点乔恩的名誉受损，永远无法在侦探界立足。在这件事上，乔恩站在了葛雷森一边。她理解汉娜的愤怒，也能体会葛雷森的心情。她愿意拿自己的前途赌上一把，让运气决定自己的结局。
两天后，乔恩被传唤到联调局。金姆探员拿出一份宣誓书，要求她承诺并非夏洛克的帮凶。原来英国领事派人送来了的凶器，上面有迈克的血迹和夏洛克的指纹。英国军情六处已声明，夏洛克的所作所为是在为女王服务。目前夏洛克已离开美国返回英国，迈克谋杀案结案。金姆探员都知道这都是屁话，唯一让她欣慰的是夏洛克终生无法再踏上美国的土地。
签下宣誓书后的乔恩孤独的回到褐石屋，一开门就惊讶的看到夏洛克坐在客厅的沙发上。夏洛克在今天早上找过汉娜，拿到了凶器。还与军情六处达成协议，用自己的前程挽救乔恩的未来。飞机还在肯尼迪机场待命，他是来向乔恩告别，感谢乔恩六年里所做的一切。半年后，夏洛克在贝克街221B的侦探生意有了起色。他敲开隔壁221A的大门，乔恩满面笑容的走了出来。二人继续为警方提供顾问服务，不过现在是在苏格兰场。
（全剧终）
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