准噶尔汗国(西里尔蒙文：Зүүнгарын хаант улс;藏文：ཇུན་གར།;维吾尔语：جوڭغار)：是准噶尔部(卫拉特蒙古的一支)的首领噶尔丹1676年打败卫拉特盟主鄂齐尔图汗之后、把松散的联盟体制步步改变为集权的政权体制、把准噶尔首领的台吉地位上升为汗王地位、于1678年正式建立的一个汗国。因为1635年卫拉特盟主固始汗遣使归顺后金(清朝)、及1646年卫拉特各部首领联名归顺清朝，所以它也改变了卫拉特与清朝的主从关系，史籍说噶尔丹对抗清朝是叛乱。
1670年，准噶尔首领巴图尔珲台吉的儿子僧格被杀后，他的异母弟噶尔丹夺得了准噶尔部的台吉位(低于汗位)。
1676年噶尔丹打败卫拉特盟主鄂齐尔图汗，把松散的联盟步步改变为垄断权力的汗国。
1678年，噶尔丹出兵南疆，占领叶尔羌汗国。1688年，噶尔丹突然率兵越过杭爱山，大举进攻土谢图汗，迫使喀尔喀蒙古诸部南迁。1690年6月，噶尔丹又向漠北喀尔喀蒙古进攻，玄烨组织左右两路大军亲征，噶尔丹溃逃。
噶尔丹败亡后，他的侄子策妄阿拉布坦继任准噶尔部台吉，准噶尔部又逐渐强大起来，与清朝再次发生冲突。1716年，准噶尔部出兵西藏，占领拉萨。1718年，清朝由青海出兵入藏，全军覆没。1720年，清朝第二次出兵，赶走准噶尔军。
1755年，清朝乾隆皇帝趁准噶尔内乱之机出兵进占伊犁、击溃达瓦齐军，并于1757年平定阿睦尔撒纳的叛乱，1760年冬天，准噶尔汗国灭亡。
历史
名称问题
土尔扈特部出走之后，就是四卫拉特(这个时期属于漠西蒙古)：和硕特部、准噶尔部、杜尔伯特部、辉特部。盟主长期是和硕特部首领(固始汗的祖先及其兄长和大侄子)。准噶尔部首领噶尔丹1675年打败卫拉特盟主鄂齐尔图汗之后、把松散的联盟体制步步改变为集权的政权体制、于1678年正式建立汗国。一般时期都是准噶尔部首领绰罗斯家族执政，所以一般称准噶尔汗国，其实最后二年是辉特部酋长阿睦尔撒纳居首领地位，所以总体上看，这个汗国，一方面论主导性质是准噶尔领导的，一方面具有某种卫拉特汗国的性质。
准噶尔部
这个时期，其领导是 “台吉”，地位低于汗，更加不是汗国(汗分为部落汗与国家汗两个层次)。
准噶尔是和明朝对峙的蒙古瓦剌部，后来瓦剌部在崛起的蒙古鞑靼部打击下向西迁移并发生分裂，在历史上又被称为卫拉特部，下面又分为准噶尔部、和硕特部、土尔扈特部和杜尔伯特部四部，也称为漠西蒙古。所辖地区北至额尔齐斯河、鄂毕河、叶尼塞河上游地区，南至天山，东到阿尔泰山和蒙古杭爱山分界线，西包巴尔喀什湖地区。
到了十七世纪，准噶尔部强大起来，将土尔扈特部向西压迫，致其与杜尔伯特部、和硕特部的一部被迫迁到了伏尔加河下游地区。
向东压迫杜尔伯特部，夺其领地，逼其内附清朝。并企图兼并和硕特部，入侵青海。准噶尔部又击败哈萨克人，翻过天山征服回部诸察合台汗及伊斯兰教派白山派与黑山派，飞兵拉萨，凌摄西藏，终于建立起了强大的准噶尔汗国。其疆域北接额尔齐斯河、鄂毕河、叶尼塞河上游，南到西藏阿里地区，西包巴尔喀什湖，东至蒙古萨彦岭及色愣格河流域，极盛时达四百多万平方公里。
1634年，准噶尔部的首领哈喇忽剌去世，其子巴图尔即首领，对外扩张疆土，并在1638年在博克塞里(今博克赛尔蒙古自治县)建成自己的城;1640年参与制定《喀尔喀—卫拉特法典》。
巴图尔被称为巴图尔珲台吉，连续两次击退俄罗斯的侵略，迫使俄罗斯承认了准噶尔汗国，两国互通贸易。此前后金已于1636年改国号为清。1648年，巴图尔珲台吉授命喇嘛咱雅班第达将过去的蒙文改造而制定成“托沁”文字，作为准噶尔的统一文字。
1653年，巴图尔珲台吉去世，其第五子僧格继承台吉，但其众兄弟不服，起兵反叛，内战爆发，至十七世纪六十年代，僧格才平定了叛乱，但在1671年，他就被自己的两个哥哥--车臣和卓特巴巴图尔暗杀，他的三个儿子都年小，台吉位难以得到延续，他的弟弟——正在西藏学习佛学的噶尔丹(僧格的同母弟)征得老师五世达赖喇嘛的同意，还俗，快速回国，在和硕特首领兼卫拉特盟主的鄂齐尔图车臣汗援助下，擒杀了车臣，并将卓特巴巴图尔赶往青海。噶尔丹自立为准噶尔汗。噶尔丹首先统一了西蒙古诸部，随后，他起兵进攻叶尔羌的黑山派和喀什噶尔的白山派，征服了这个察合台汗国。又于1681年征服了土鲁番汗国的察合台汗。
归顺清朝
顺治三年(1646)，卫拉特各部(包括准噶尔部)首领二十二人联名奉表贡，清廷赐以甲胄弓矢，命其统辖诸部。——确定了主权关系，青藏高原和新疆等地 正式纳入清朝的主权版图(1635年还没有“命其统辖”，没有这种形式上的确认性授权关系)。 因此，噶尔丹对抗清朝，在关系上是叛乱。
打败盟主
清朝后期的西域卫拉特有松散的联盟，卫拉特是成吉思汗时期北方民族归附于蒙古族的(《蒙古-卫拉特法典》里条文也就是并列蒙古与卫拉特两个概念的)，和硕特首领氏族(固始汗的祖先)是成吉思汗弟弟的后代，因此地位较高，担任卫拉特盟主。
1636年和硕特首领兼卫拉特盟主固始汗遣使表示归顺后金(清朝前身)，因为他是盟主，所以他归附清朝也代表卫拉特归附清朝，而后来噶尔丹对抗清朝是一种反叛了。
固始汗1637年去青藏高原发展时，把和硕特首领兼卫拉特盟主的位子交予大侄子鄂齐尔图汗。1675—1676年准噶尔部首领噶尔丹派兵击败盟主鄂齐尔图汗，把卫拉特诸部的松散联盟变为准噶尔垄断权力的政权即准噶尔汗国。
建立汗国
打败和硕特首领兼卫拉特盟主的鄂齐尔图汗，并不就是建立汗国，噶尔丹此后一步步改变联盟的性质、建立垄断权力，形成了以他为首的绰罗斯家族的政权：噶尔丹已完全控制了卫拉特全境。噶尔丹洪台吉颁布了一些法令，其内容涉及办案、卫拉特人和南疆回部的纷争、婚事以及对人贩子的处理等项具体条文。与此同时，噶尔丹取消了各自为政，互不统属的传统的松散的卫拉特联盟，还取消了各部族长的权力和各部大小洪台吉、克什(太师)、济农等称谓。在完善和加强鄂托克编制的基础上，将部族长的权力分散到各鄂托克宰桑手里。噶尔丹的一切指示 和命令，直接传达到各鄂托克宰桑处，由宰桑具体执行，并向噶尔丹负责。噶尔丹将各鄂托克的支配权，高度集中在自己手里，从而完成了联盟制向国家政权的过渡。
1678年，噶尔丹获得了五世达赖喇嘛所赠 “噶尔丹博硕克图汗” 之号。为此，噶尔丹博硕克图汗举行了隆重的大典，喀尔喀札萨克图汗成衮也前来参加。准噶尔汗国就这样形成。
四处征服
噶尔丹深受喇嘛教的影响，一直想建立一个以喇嘛教为国教的准噶尔帝国，所以，他第一步在1678年率兵攻灭了叶尔羌汗国(今中国南疆附近)，同时，又用兵于哈萨克，巩固在那里的统治。
在他扫除一切障碍准备实施自己的计划时，却因多疑埋下了自己日后败亡的种子：随着时间的推移，僧格的三个儿子都已长大成人，尤其长子策妄阿拉布坦更是英武不凡，按准噶尔法律，策妄阿拉布坦才应是合法的准噶尔部首领位继承人，噶尔丹为不大权旁落，便逐渐打压策妄阿拉布坦，在1688年，暗杀了他的弟弟索诺布阿拉布坦，这使策妄阿拉布坦感到自身安全难以保障，便在7名僧格旧臣的陪同下，率五千部众，逃至博尔塔拉河一代休养生息。
攻打东蒙古
噶尔丹没有将策妄阿拉布坦放在眼里，在征服了西方的哈萨克汗国之后，便集结兵马和清朝中央政府互相争夺原漠南、漠北，在1690年，攻入喀尔喀，长驱东进，直取乌珠穆沁，然后拨转锋芒，在赤峰附近的乌兰布通南下。
对抗清朝
1688年，准噶尔大军攻入漠北，喀尔喀土谢图部车臣部等迎战失败，乃逃入内蒙古，向清帝国投降。噶尔丹于1690年率军追杀进入内蒙古。
喀尔喀诸部首领都无法抵挡，于是联名向康熙皇帝求救，爱新觉罗·玄烨率领清军，与噶尔丹的准噶尔军在乌兰布通交战，噶尔丹虽然英勇善战，并发明了著名的“驼城”战术，但仍然被装备有重型火炮的清朝军队打败。与此同时，策妄阿拉布坦率军进攻噶尔丹后方，控制了北到额尔齐斯河上游、东到乌布苏湖的整个地区，包括吐鲁番、库车等新疆的广大领土，从背后形成了对噶尔丹根据地科布多的包围。
噶尔丹之死
撤回根据地的噶尔丹已陷于两大强敌的夹击之中，但他认为只要击败清朝军队，打通自己向东的通道，策妄阿拉布坦便不足挂齿。于是，在1695年，噶尔丹再度进兵喀尔喀，这时的喀尔喀已被清占领，康熙再次亲征，噶尔丹抱定必胜的决心，但这时他的实力与上次相比已大为不如，而康熙却集结更多的人马欲将他彻底消灭，两军经过了极为惨烈的战争，噶尔丹的大妃阿奴也在战斗中战死。最终，他的3万铁骑难以击败康熙的20万大军，大败亏输，而这时，策妄阿拉布坦又夺取了他控制下的哈密，切断了他的回路，在逃亡一年后，即1697年3月13日，在阿尔泰的阿察阿穆塔台，噶尔丹服毒自杀。
策妄时期
翌年9月，策妄阿拉布坦遣使清朝，献上噶尔丹尸体，向清朝臣服。次年，策妄阿拉布坦正式登上了首领的宝座。
策妄阿拉布坦与其儿子噶尔丹策零统治时期(1698年~1745年)，是准噶尔汗国的鼎盛阶段，号称拥有三十万大军，数次击败清朝军队。
1727年，策妄阿拉布坦去世，其子噶尔丹策零即位。雍正发军进攻准噶尔，结果大败，清军退出科布多。1735年，雍正和准噶尔帝国签订和约，规定两大帝国以漠北杭爱山为界，以东属清，以西属准噶尔。
1745年，噶尔丹策零去世，其子策妄多济那穆扎勒即位，称为阿占汗，他年少又荒唐不理政务，并且囚禁了替自己管理国家的姐姐鄂兰巴雅尔，致使姐夫萨英博落克秘密拥立阿占汗的异母兄喇嘛达尔扎，杀死了阿占汗，汗国长年陷于内乱。经过一番内乱，1753年，猛将策零顿多布之孙达瓦齐即位。
汗国灭亡
准噶尔蒙古的这些内战，不仅使卫拉特蒙古各部人民蒙受巨大损失，生活遭受极大困难，同时也不断削弱了为卫拉特封建主力量，使其再无力顾及自己的属国哈萨克汗国，相反要借助哈萨克汗国的力量来维护其摇摇欲坠的封建政权了。达瓦齐的登位除了得到哈萨克汗国阿布赉的支持外，还得到了辉特部酋长阿睦尔撒纳的大力支持。原先达瓦齐和阿睦尔撒纳的牧地毗连，都在塔尔巴哈台地区，从这里逃向以叶西尔河为政治中心的阿布赉汗处最为近便。开始两人由于共同反对喇嘛达尔扎而形成同盟，可是达瓦齐登位后，暴虐混淫，倒行逆施。由于达瓦齐没有满足阿睦尔撒纳所要求分给他的领地，两人大动干戈，掀起战争。阿睦尔撒纳战败，投向清朝。于是清朝筹集大军于1755年春分南北两路进攻达瓦齐。达瓦齐军在清军和阿布赉军的东西夹击下，很快就溃逃瓦解，达瓦齐也被霍集斯伯克擒获送交清朝，后清朝又在1757年平定阿睦尔撒纳的叛乱，准噶尔汗国彻底灭亡。
1759年，兆惠率清军征服天山南路，至此天山南北尽并入清帝国版图。
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